Link zur Webseite befindet sich in der Zwischenablage
Die einen lieben es, die anderen hassen es: das elektronische Laborjournal (ELN).
Bild von Michael JeltschDie einen lieben es, die anderen hassen es: das elektronische Laborjournal (ELN). Bereits vor einem Jahrzehnt lautete die Prognose, dass das Laborjournal in Papierform in zehn Jahren der Vergangenheit angehören würde. In Wirklichkeit verwendet die Mehrheit der akademischen Labore im Jahr 2022 jedoch nach wie vor Papier. Der Übergang wurde durch buchstäblich Hunderte kommerzieller Angebote, die alle untereinander inkompatibel sind, nicht gerade erleichtert. Wir haben 2013 begonnen, mit ELNs zu experimentieren, und dabei einige kommerzielle sowie Open-Source-Lösungen getestet. Die schlechtesten Anbieter erlaubten uns nicht einmal, die Software vor dem Kauf zu testen (z. B. scheint LabVantage davon auszugehen, dass man das Produkt nicht kaufen wird, sobald man es ausprobiert hat – und damit liegen sie goldrichtig!). Wir haben uns für
eLabFTW
entschieden, ein Open-Source-Projekt, dessen Hauptentwicklung am Institut Curie in Paris, Frankreich, stattfindet. Es handelt sich um eine mit PHP und MySQL erstellte Webanwendung. Es gibt auch eine begutachtete Veröffentlichung, die das Projekt beschreibt:
https://doi.org/10.21105/joss.00146
sowie ein allgemeiner Übersichtsartikel in „Nature Protocols“, der sich mit der Implementierung von ELN befasst:
https://doi.org/10.1038/s41596-021-00645-8
.Einsatz in der Lehre an der Universität Helsinki Mit dem jüngsten Update auf
Version 4.3
wurde die letzte Hürde für den großflächigen Einsatz genommen. Jeder mit einem helsinki.fi-Konto kann sich nun mit den Zugangsdaten seines Universitätskontos im System anmelden. Dies erleichtert die Einbindung vieler neuer Nutzer erheblich. Ich plane, das System für unseren neuen Kurs „Rekombinante DNA-Technologie und Gentechnik“ zu nutzen. Derzeit ist der Server nur aus dem Universitätsnetzwerk heraus erreichbar. Wenn Sie ihn von zu Hause aus nutzen möchten, benötigen Sie ein VPN. Im Laufe der Jahre sind etwa 25 Nutzer hinzugekommen, und es wird interessant sein zu sehen, wie sich das System bewährt, wenn sich die Nutzerzahlen verdoppeln oder vervierfachen. Das System läuft in einem Docker-Container auf einem virtuellen Server mit Ubuntu 20.04 LTS, den wir leider ohne zusätzliche finanzielle Unterstützung weder aktualisieren noch erweitern können. Wenn du also Interesse an der Nutzung eines ELN hast, sichere dir noch heute deinen Platz, indem du dich unter
https://elab.ltdk.helsinki.fi
anmeldest und unten die Option „Login through your institution“ wählst. Dort hast du die Möglichkeit, ein Team auszuwählen. Der Teamadministrator muss Sie erst freischalten, bevor Sie das System nutzen können. Wenn Sie Ihr Labor nicht unter den Teams finden können, bedeutet dies, dass Sie der erste Nutzer aus Ihrem Labor sind, der dieses System nutzt. In diesem Fall sollten Sie das Team „Helsinki University“ auswählen und mich per E-Mail (
michael@jeltsch.org
) kontaktieren, da ich ein neues Team für Ihr Labor registrieren muss und Sie der Administrator dieses neuen Teams sein werden.Zugang für BesucherWenn Sie kein Konto der Universität Helsinki haben, können Sie das System dennoch nutzen, sofern Sie sich im Eduroam-Netzwerk der Universität Helsinki befinden. Sie müssen jedoch den Link „Jetzt registrieren“ verwenden, und Ihr Konto muss von einem Systemadministrator genehmigt werden.Ausführung auf Ihrem lokalen RechnerDie Systemanforderungen von eLabFTW sind relativ gering, und Ihr Laptop dürfte keine Probleme haben, eine lokale Kopie des Docker-Containers auszuführen. Die Installation von eLabFTW auf einem neueren Windows- oder macOS-Computer ist zwar möglich, jedoch in gewisser Weise kontraproduktiv, da dadurch weder Netzwerkzugriff noch Teamfunktionen zur Verfügung stehen. Selbst wenn Sie all das nicht benötigen, würde ich Ihnen empfehlen, einen alten Desktop-Computer für diese Aufgabe umzufunktionieren und das Programm auf einer regulären Linux-Serverinstallation auszuführen. Gerne beantworte ich alle Fragen, die Sie möglicherweise haben (sowohl aus der Perspektive eines Systemadministrators als auch aus der eines Endnutzers).