Bearbeitung on Michael’s Domain

Proteinaufreinigung mit Äkta & Unicorn

Sun, 19 Apr 2026 00:00:00 +0000

Proteine (und andere Biomoleküle) werden meistens über chromatographische Methoden aufgereinigt. Es gibt einige wenige Hersteller, die spezielle Chromatographiesysteme entwickelt haben, die für Biomoleküle wie Proteine, Nukleinsäuren und Viren optimiert sind. Die bekanntesten Systeme sind die NGC-Maschinen von BioRad und die Äkta-Maschinen von Cytiva (previously GE HEalthcare, previously Amersham, previously Pharmacia). Unsere Fakultät hat vor kurzem ein Äkta Avant angeschafft, und wir sind fast fertig mit der Einrichtung. Es ist bereits in das universitätseigene Reservierungssystem integriert. Nur das automatisierte Backup-System klappt noch nicht. Ich benutze Äkta-Geräte seit 1996, als Professor Jorma Keski-Oja einen der ersten Äkta Explorer für das Haartman-Institut kaufte. Die Software war und ist immer noch Unicorn, aber wir sind jetzt bei Version 7, die im Vergleich zu den Unicorn-Versionen aus dem letzten Jahrtausend einen modernen, weniger überladenen Look hat. Doch selbst nach mehr als 10 Jahren Entwicklung ist Unicorn 7 noch nicht auf dem gleichen Funktionsstand wie die alten Versionen. Daher bietet das Evaluation-Modul die Option, auf Evaluation Classic zurückzuschalten. Wenn Sie beispielsweise personalisierte und stilvolle Chromatogramme in Ihren Vorträgen präsentieren möchten, benötigen Sie immer noch Evaluation Classic! Das neue Evaluation-Modul verfügt zwar über Schnellfunktionen zum Exportieren von Kurven in Präsentationssoftware wie PowerPoint, aber das ist alles pixelbasiert und daher nach dem Export nicht mehr einfach zu bearbeiten. Um professionell zu arbeite, sollte man die Kurven in das branchenübliche SVG-Vektorgrafikformat exportieren. Das kann man mit jedem modernen Vektorgrafik-Editor wie Canva, Adobe Illustrator oder Inkscape bearbeiten. Wenn man in Evaluation Classic mit der rechten Maustaste in das Chromatogramm klickt, hat man die Möglichkeit, das Chromatogramm als Metadatei zu speichern. In der aktuellen Unicorn-Version führt dies unter Windows 11 jedoch zu einem Fehler. Aber es gibt einen Workaround:

Exportieren von Avidemux ins MP4-Format

Sat, 20 Sep 2025 00:00:00 +0000

Aus irgendeinem Grund stürzt Unitube , der universitätseige Video-Distribution und Streaming-Service neuerdings immer beim Versuch ab, eine MKV-Datei hochzuladen. Letztes Jahr hat das noch funktioniert… Nur proprietäre Formate scheinen in Ordnung zu sein (wie etwa MP4). Das macht mir viel zusätzliche Arbeit, da ich Open-Source-Tools verwende, um meine Vorlesungsaufzeichnungen zu bearbeiten (hauptsächlich, um unnötige Teile herauszuschneiden). Um jedoch eine MP4-Datei zu erstellen, muss ich transkodieren, was ein zeitaufwändiger Prozess ist, der die Änderung vieler Standardeinstellungen erfordert. Und so geht das im Open Source-Programm Avidemux:

Bearbeitung der Zoom-Aufzeichnungen von Online-Unterricht mit FFmpeg

Wed, 25 Nov 2020 00:00:00 +0000

Basierend auf dem Feedback der Studierenden haben wir einen neuen Kurs für das TRANSMED MSc-Programm über Arzneimittelentwicklung organisiert. Es ist das, was man im Deutschen einen “Schnupperkurs” nennt. Ich habe nie eine zufriedenstellende Übersetzung dieses Wortes ins Englische gefunden. Es bedeutet, dass wir lediglich das Interesse der Studenten an diesem Thema wecken wollen. Wenn er ihnen gefällt, können sie einen der vielen vertiefenden Kurse belegen, die z.B. an der Pharmazeutischen Fakultät angeboten werden, wo es in den kommenden Jahren aufgrund des geplanten internationalen MSc-Programms in Pharmazie mehr Unterricht auf Englisch geben wird.

MPEG-Filmdateien schneiden (mpgtx)

Wed, 04 Apr 2007 00:00:00 +0000

Ich habe eine Fernsehdokumentation als MPEG-2-Datei aufgenommen. Um sie über das Internet verbreiten zu können, muss ich ihre Dateigröße verringern und verwende dafür den DivX-Codec. Zunächst wollte ich jedoch den Anfang und das Ende kürzen. Ich habe mpgtx verwendet, ein sehr praktisches Befehlszeilen-Tool. Es gibt SUSE-RPMs von Packman . Der Befehl lautete mpgtx -s tutkittu_juttu.mpg [00:22.50-26:55.00] -o cut.mpg