DPBM on Michael’s Domain

Praktikum: Aufreinigung und Charakterisierung rekombinanter Proteine (DPBM-135)

Sun, 10 Dec 2017 00:00:00 +0000

Unterrichtsmaterialien, Ergebnisse usw. für den DPBM-Kurs „Aufreinigung und Charakterisierung rekombinanter Proteine“ ( https://courses.helsinki.fi/en/DPBM-135/120171139 ):

Aufreinigung und Charakterisierung rekombinanter Proteine

Mon, 20 Mar 2017 00:00:00 +0000

Wir organisieren (erneut) einen praxisorientierten Kurs zur Proteinreinigung vom 4. bis zum 20. Dezember. Wir können maximal 16 Teilnehmer aufnehmen, die in Gruppen von 2 bis 4 Teilnehmern eingeteilt werden. Jede Gruppe benötigt drei volle Tage, um die praktischen Übungen durchzuführen, wobei sich der dritte Tag des Kurses mit dem ersten Tag der nächsten Gruppe überschneidet. Veranstaltungsort ist das Biomedicum Helsinki, Räume A516a1 (wo sich die Geräte befinden) und B318a/b (unser Labor). Wir werden ein Protein (VEGF-Rezeptor 3) mithilfe eines zweistufigen Protokolls (Affinitätschromatographie + Gelfiltration) auf dem Äkta Avant FPLC-Gerät aufreinigen. Am dritten Kurstag werden wir die Wechselwirkung dieses Proteins mit seinem Liganden (VEGF-C) auf dem ITC-Gerät (isotherme Kalorimetrie) untersuchen. Wir haben bereits 2015 einen ähnlichen Kurs angeboten ( http://www.helisci.fi/hbgs/FPLC2015/) . Dieser neue Kurs ( https://courses.helsinki.fi/en/DPBM-135/120171139 ) wird einen ähnlichen Aufbau haben, wir erweitern ihn jedoch um einen Tag, um Protein-Wechselwirkungen mithilfe des neuen Isothermischen-Kalorimetrie-Geräts unserer B3P-Kernanlage zu analysieren. Die Dokumentation und die Ergebnisse werden ebenfalls hier verfügbar sein.Da wir maximal zwei Proben gleichzeitig bearbeiten können (wir verfügen „nur“ über zwei FPLC-Geräte), müssen wir die Teilnehmer in Gruppen (mit jeweils 2–4 Studierenden) aufteilen und den dreitägigen Kurs je nach Teilnehmerzahl mehrmals wiederholen.

Cloning-Club – Workshop-Material

Tue, 30 Aug 2016 00:00:00 +0000

Sammlung der Kursunterlagen für den von DPBM organisierten Cloning Club zusammengestellt. Für jede Vorlesung gibt es Dateien in (mindestens) zwei verschiedenen Formaten: PDF und ODP (Open Document Presentation). Die ODP-Datei lässt sich mit der Software LibreOffice bearbeiten. Wenn Sie sie mit Microsoft Office öffnen möchten, müssen Sie sie zunächst entweder mit LibreOffice oder einem Online-Konvertierungstool (wie cloudconvert ) konvertieren. Das Material des Kursveranstalters (im Open-Document- und PDF-Format) steht unter der Creative-Commons-Lizenz zur Verfügung (ausgenommen ist angepasstes Material, das ausdrücklich gekennzeichnet ist). Materialien der Kursteilnehmer (im PowerPoint-Format) werden zu den Bedingungen der Urheber bereitgestellt. Möglicherweise füge ich später auf Grundlage des Feedbacks der Teilnehmer verbesserte Versionen der Präsentationsfolien für die Treffen bzw. Vorlesungen hinzu.

Klonier-Club

Wed, 22 Jun 2016 00:00:00 +0000

Gemeinsam mit dem Doktorandenprogramm für Biomedizin (DPBM) organisieren wir im Herbst 2016 einen Workshop und einen Praxiskurs zum Thema Klonieren (Kurscode 921244).Termine und Veranstaltungsort (Workshop): Wöchentlicher Diskussionsworkshop (8 Termine à 1 bis 1,5 Stunden) ab Dienstag, 30.8.2016; Veranstaltungsort: Besprechungsraum 7 (Biomedicum Helsinki, 5. Stock, außer am 27.09. und beim letzten Workshop am 25.10., die in BM B136A stattfinden); 1 KreditpunktTermine und Veranstaltungsort (Praktikum): Dezentraler Laborkurs (nach Zeitplan und am Veranstaltungsort der Teilnehmenden oder – für Teilnehmende ohne eigenen Zugang zu den erforderlichen Einrichtungen – in den ersten beiden Novemberwochen in unserem Labor); 1 KreditpunktKursinformationsseite: http://www.helisci.fi/hbgs/cloning-club2016 Anmeldeseite: https://elomake.helsinki.fi/lomakkeet/71701/lomake.html Detaillierte Kursinformationen: PDF Werbeplakat: PDF Kursmaterial: Das Material wird nach jedem Treffen hier hinzugefügt . Das Klonieren hat den Reiz, langweilig zu sein. Doch alles beginnt mit der DNA. Die Gentechnik ist nicht mehr wegzudenken, und wird auch zukünftig immer wichtiger werden: Wir kratzen gerade erst an der Oberfläche ihres Potenzials. Fast die gesamte biomedizinische Forschung befasst sich mit DNA-Konstrukten: Expressionsvektoren zur Transfektion von Zellen, Shuttle-Plasmide zur Herstellung von Viren, Konstrukte zur Erzeugung transgener Tiere. Die Fähigkeit, ein DNA-Konstrukt zu erstellen, wird noch benötigt, bis das versprochene Gerät auf den Markt kommt, das jedes Plasmid innerhalb weniger Stunden ausspuckt, nachdem man ihm die Plasmidsequenz eingegeben hat. Es stehen viele neue Technologien zur Verfügung, und daher ist die Auswahl schwieriger als früher, als das Klonieren mit Restriktionsenzymen die einzige Option war. Heute sind die Anforderungen und Möglichkeiten endlos, und man muss die richtige Strategie wählen, um Erfolg und Geschwindigkeit zu maximieren.

Praktische Molekularbiologie und Gentechnik

Mon, 08 Sep 2014 00:00:00 +0000

Sammlung der Präsentationsfolien für den DPBM -Kurs Praktische Molekularbiologie und Gentechnik . Für jede Vorlesung liegen Dateien in (mindestens) zwei verschiedenen Formaten vor: PDF und ODP (Open Document Presentation). Die ODP-Datei lässt sich mit der Software LibreOffice bearbeiten. Wenn Sie sie mit Microsoft Office öffnen möchten, müssen Sie sie zunächst entweder mit LibreOffice oder einem Online-Konvertierungstool (wie cloudconvert ) konvertieren. Das gesamte Material steht unter der Creative-Commons-Lizenz zur Verfügung. Möglicherweise werde ich später auf Grundlage des Feedbacks der Teilnehmer verbesserte Versionen der Vorlesungsfolien hinzufügen. Die Folie über Restriktionsenzyme (REs) und die Berechnung der erforderlichen RE-Mengen zum Verdauen einer bestimmten DNA-Menge befindet sich in der Datei zu Vorlesung 1.