Lehre on Michael’s Domain

Meine Lehrveranstaltungen

Fri, 26 Jan 2024 00:00:00 +0000

IN RED - as (one of the) responsible teacher(s); * - as course developer

Current wet lab teaching
*DPDR-305 (1 ECTS) Purification of Recombinant Proteins and Protein Drugs by FPLC Introduction Methods Protein tags PROV-004 (5 ECTS) Introduction to cell and molecular biology methods Alternative assignment: Expression, purification and functional testing of Phusion polymerase Practical: PCR Work PROV-410* (4 ECTS)** Recombinant DNA technology in therapeutic protein engineering - laboratory work

Current wet lab teaching

DPDR-305* (1 ECTS) Purification of Recombinant Proteins and Protein Drugs by FPLC
PROV-004 (5 ECTS) Introduction to cell and molecular biology methods
- Alternative assignment: Expression, purification and functional testing of Phusion polymerase
- Practical: PCR Work
PROV-410* (4 ECTS) Recombinant DNA technology in therapeutic protein engineering - laboratory work

Current courses
FARM-310 (5 ECTS) Biopharmaceuticals, basic course Luento #3: Terapeuttiset proteiinit I: Insuliinit ja insuliinianalogit Lecture #3: Therapeutic proteins I: Insulin ja insulin analogs Luento #4: Terapeuttiset proteiinit II: Erytropoietiini, interferonit, & G-CSF Lecture #4: Therapeutic proteins II: Erythropoietin, interferons, & G-CSF Luennot #5+#6: Terapeuttiset proteiinit III: Vasta-aineet ja fuusioproteiinit Lectures #5+#6: Therapeutic proteins III: Antibodies and fusion proteins PROV-004 (5 ECTS) Introduction to cell and molecular biology methods Lecture #1: Alternative Assignment: Protein Production & Purification Lecture #2: Protein Purification Methods Lecture #3: Protein Purification Tags Lecture #4: PCR lecture *PROV-409 (1 ECTS) Recombinant DNA technology in therapeutic protein engineering - lecture & exercise course Session #1: Introduction to Recombinant DNA Technology: Restriction Enzymes, PCR, Plasmids, Transformation Session #2: Multifragment assembly (“Gibson” and similar), Golden Gate, mutagenesis methods, CRISPR/Cas systems Session #3: Databases, sequences, software, bioinformatics for your cloning Session #4: Vectors and systems for protein expression Session #5: How to make transgenic organisms and recombinant viruses PROV-216 (5 ECTS) Molecular Pharmacology VEGFs and VEGF receptors PROV-204 (5 ECTS) Biological Drugs II Antibodies, antibody fusions and antibody conjugates as drugs TMED-929* (1-2 ECTS) Drug discovery & development with a focus on biologics Introductory lecture Protein drugs group work kick-off Vaccines, vaccine development & biological warfare: The smallpox vaccine Challenges in formulation, production and quality control Evidence-based medicine, science-based medicine, and complementary and alternative medicine PROV-303 (5 ECTS) Advanced Biopharmaceutics Session #6: Biological barriers: The blood brain barrier Session #8: Recombinant DNA Technology (aka “cloning”) is the starting point for nearly every biological drug …and much more Session #9: Transgenic animals: For drug production, generating human antibodies and making animal models of human diseases Session #10: Protein Drugs: Engineering and Case Studies GMB-401 (5-10 ECTS) Integrative health biosciences Clinical Trials MPHARM-002A/PROV-105A (11 ECTS) Drug development and preclinical evaluation Discovery, Development and Optimization of Protein Drugs MPHARM-002B/PROV-105B (11 ECTS) Pharmaceutical product development and rational use of medicines Biophamaceuticals - Challenges in formulation, production and quality control MPHARM-009 (5 ECTS) Introduction to research methods in drug discovery and development – theory Plans for the future… Protein production and purification Stable cell line generation FARM-314 (5 ECTS)** Medicinal preparations I Basic Issues in the Formulation of Biophamaceuticals

Current courses

FARM-310 (5 ECTS) Biopharmaceuticals, basic course
- Luento #3: Terapeuttiset proteiinit I: Insuliinit ja insuliinianalogit Lecture #3: Therapeutic proteins I: Insulin ja insulin analogs
- Luento #4: Terapeuttiset proteiinit II: Erytropoietiini, interferonit, & G-CSF Lecture #4: Therapeutic proteins II: Erythropoietin, interferons, & G-CSF
- Luennot #5+#6: Terapeuttiset proteiinit III: Vasta-aineet ja fuusioproteiinit Lectures #5+#6: Therapeutic proteins III: Antibodies and fusion proteins
PROV-004 (5 ECTS) Introduction to cell and molecular biology methods
- Lecture #1: Alternative Assignment: Protein Production & Purification
- Lecture #2: Protein Purification Methods
- Lecture #3: Protein Purification Tags
- Lecture #4: PCR lecture
PROV-409* (1 ECTS) Recombinant DNA technology in therapeutic protein engineering - lecture & exercise course
- Session #1: Introduction to Recombinant DNA Technology: Restriction Enzymes, PCR, Plasmids, Transformation
- Session #2: Multifragment assembly (“Gibson” and similar), Golden Gate, mutagenesis methods, CRISPR/Cas systems
- Session #3: Databases, sequences, software, bioinformatics for your cloning
- Session #4: Vectors and systems for protein expression
- Session #5: How to make transgenic organisms and recombinant viruses
PROV-216 (5 ECTS) Molecular Pharmacology
- VEGFs and VEGF receptors
PROV-204 (5 ECTS) Biological Drugs II
- Antibodies, antibody fusions and antibody conjugates as drugs
TMED-929* (1-2 ECTS) Drug discovery & development with a focus on biologics
PROV-303 (5 ECTS) Advanced Biopharmaceutics
GMB-401 (5-10 ECTS) Integrative health biosciences
- Clinical Trials
MPHARM-002A/PROV-105A (11 ECTS) Drug development and preclinical evaluation
- Discovery, Development and Optimization of Protein Drugs
MPHARM-002B/PROV-105B (11 ECTS) Pharmaceutical product development and rational use of medicines
- Biophamaceuticals - Challenges in formulation, production and quality control
MPHARM-009 (5 ECTS) Introduction to research methods in drug discovery and development – theory
FARM-314 (5 ECTS) Medicinal preparations I
- Basic Issues in the Formulation of Biophamaceuticals

Teaching Videos
2025 Biologiset Lääkkeet (in Finnish) (Unitube) Biologiset lääkkeet: Intro ja historia Linkki Biologiset lääkkeet: Tuotanto, stabiilius, säilytys ja käsittely Linkki Biologiset lääkkeet - Biosimilaarit, biobetterit ja lainsäädäntö Linkki Esimerkkejä biologisista lääkkeistä Biologiset lääkkeet - Metaboliset sairaudet Linkki Biologiset lääkkeet - Syövän hoitoon tarkoitetut vasta-aineet Linkki Biologiset lääkkeet - Vasta-ainekonjugaatit Linkki Biologiset lääkkeet - Bispesifiset vasta-aineet Linkki Biologiset lääkkeet - Vasta-aineet Alzheimerin taudin hoitoon Linkki Biologiset lääkkeet - Tulevaisuus Linkki

Teaching Videos

2025 Biologiset Lääkkeet (in Finnish) (Unitube)
1. Biologiset lääkkeet: Intro ja historia Linkki
2. Biologiset lääkkeet: Tuotanto, stabiilius, säilytys ja käsittely Linkki
3. Biologiset lääkkeet - Biosimilaarit, biobetterit ja lainsäädäntö Linkki
Esimerkkejä biologisista lääkkeistä
1. Biologiset lääkkeet - Metaboliset sairaudet Linkki
2. Biologiset lääkkeet - Syövän hoitoon tarkoitetut vasta-aineet Linkki
3. Biologiset lääkkeet - Vasta-ainekonjugaatit Linkki
4. Biologiset lääkkeet - Bispesifiset vasta-aineet Linkki
5. Biologiset lääkkeet - Vasta-aineet Alzheimerin taudin hoitoon Linkki
1. Biologiset lääkkeet - Tulevaisuus Linkki

Previous wetlab teaching
2014 - 2019 DPBM-135 Purification and Characterization of Recombinant Proteins (organized yearly until Covid-19) 2015 2017 2015 - 2017 DPBM Cloning Club (wetlab part) 2014 DPBM Practical Molecular Biology and Genetic Engineering (wetlab part) 2010 HBGS Tags in protein expression, detection and purification

Previous courses
2018-2022 DPBM-119 Protein Interaction Biochemistry 2018 Cell-based assays for protein interaction detection & quantification 2022 Cell-based assays for protein interaction detection & quantification 2017 DBPM CancerBio Summer School A short histrory of antiangiogenic tumor treatment 2014 DPBM Practical Molecular Biology and Genetic Engineering (lecture part) 2011 Lymphatic Research lecture series (six lectures) Lecture #1: Introduction to Lymphatic Research

Previous courses

2018-2022 DPBM-119 Protein Interaction Biochemistry
- 2018 Cell-based assays for protein interaction detection & quantification
- 2022 Cell-based assays for protein interaction detection & quantification
2017 DBPM CancerBio Summer School
- A short histrory of antiangiogenic tumor treatment
2014 DPBM Practical Molecular Biology and Genetic Engineering (lecture part)
2011 Lymphatic Research lecture series (six lectures)
- Lecture #1: Introduction to Lymphatic Research

Workshops
2015 - 2017 DPBM Cloning Club (workshop part)

Der Studiengutschein

Sat, 04 Apr 2026 00:00:00 +0000

Da ich an der Universität Helsinki (UH) arbeite, sollte ich wohl etwas mehr über das kommende Pilotprojekt zum Studiengutschein (finnisch: opintoseteli) wissen, da die UH im Rahmen dieses Programms eine Menge Kurse anbieten wird, darunter auch einige von meinen, wie z. B. den Kurs Rekombinante DNA-Technologie (auch bekannt als „Klonieren“) . Ich habe mich ein wenig eingelesen, und hier ist das Wichtigste im Überblick:

Wie man die farbenblind-sichere Nature Color Palette für Inkscape installiert

Wed, 28 Jan 2026 00:00:00 +0000

Unter Linux ist das ganz einfach und schnell erledigt. Eine Anleitung zur Installation dieser Farbpalette unter Windows oder macOS findest du hier: https://github.com/atsuyaw/NatureColorPalette .

Immer noch am Überlegen, was du studieren sollst?

Sat, 20 Dec 2025 00:00:00 +0000

Wenn ich heute 20 Jahre alt wäre, würde ich mich in einen interdisziplinären Studiengang einschreiben. Mein Favorit unter den in Finnland angebotenen Programmen ist der Internationale Masterstudiengang in Pharmazie (offiziell “Master’s Programme in Pharmaceutical Research, Development and Safety”, abgekürzt MPHARM) an der Universität Helsinki. Ich gebe dir fünf überzeugende Gründe:

Der finnische Wunschtraum

Mon, 15 Dec 2025 00:00:00 +0000

Ein Realitätscheck für internationale Studenten

Finnland wird seit nunmehr acht Jahren in Folge als das glücklichste Land der Welt gefeiert . Finnland ist jedoch nicht nur das glücklichste Land, sondern auch das Land mit einer der niedrigsten Geburtenraten . Um das Rentensystem zu stabilisieren, hat Finnland beschlossen, dass es Einwanderung braucht – eine Idee, die für ein Land, das vor 30 Jahren fast so isoliert vom Rest Europas war wie Nordkorea heute vom Rest Asiens, sehr radikal war. Zu dieser Zeit war das internationale Autokennzeichen für Finnland noch SF für Sowjet-Finnland (nur ein Scherz, das S steht natürlich für Schweden). Finnland will die Einwanderung erhöhen, indem es ausländische Studenten anlockt, in Finnland einen Abschluss zu machen, in der Hoffnung, dass einige von ihnen nach dem Abschluss im Land bleiben. Daher ist Finnland zu einem immer beliebteren Ziel für internationale Studenten geworden, insbesondere aus Asien. Angelockt durch das Versprechen eines qualitativ hochwertigen Lebens, exzellenter Bildung und zahlreicher Möglichkeiten, investieren viele massiv, um einen Abschluss an einer der finnischen Universitäten zu erlangen. Vor zehn Jahren war die universitäre Ausbildung für alle (einschließlich aller Ausländer) kostenlos, aber seit 2017 müssen Studenten aus Nicht-EU/EWR-Ländern Studiengebühren zahlen . Dies war nicht die eigene Entscheidung der Universitäten, sondern wurde von der Regierung vorgeschrieben.

Quiz results

Thu, 06 Nov 2025 00:00:00 +0000

Akademische Karriere

Sun, 03 Aug 2025 00:00:00 +0000

Ein winziger Arbeitsmarkt, aber das beste europäische Land zum Leben (in Anbetracht der globalen Erwärmung)

Diesen Monat bin ich an meiner Universität vom Associate Professor zum ordentlichen Professor (Full Professor) befördert worden. Da ich auf die Meinung meines Doktorvaters Kari Alitalo , meiner derzeitigen Vorgesetzten und fast aller anderen vertraut habe, hatte ich keinen Plan B vorbereitet für den Fall, dass mir die Festanstellung (Tenure) verweigert würde. Was hätte für einen Angehörigen der Generation X auf dem finnischen Arbeitsmarkt ein realistischer Plan B sein können? Ein Blick auf den internationalen Arbeitsmarkt würde die Lösung des Problems erleichtern, da sich die beruflichen Möglichkeiten um den Faktor 100 erhöhen würden, selbst wenn man nur englisch- und deutschsprachige Länder berücksichtigt. Finnlands Bevölkerung beträgt nur etwa 5,6 Millionen, und sein Arbeitsmarkt ist winzig. Ein Umzug ins Ausland ist jedoch nicht so einfach, wenn der Rest der Familie gegen einen Tapetenwechsel ist. Und warum sollte ich das einzige Land in Europa verlassen, dessen Sommertemperaturen nicht gesundheitsgefährdend sind? Sicher, die globale Erwärmung trifft auch die nordischen Länder: Wir hatten gerade die längste ununterbrochene Hitzewelle in Finnland , seitdem Messungen durchgeführt werden (22 Tage mit >30°C). Aber 30°C schlagen 40°C um Längen. Für meine amerikanischen Freunde & Familie: 30°C = 86°F, 40°C = 104°C.

Lern- und Lehrmaterialien über Biopharmazeutika/Biopharmaka

Sun, 08 Jun 2025 00:00:00 +0000

Vorlesungsfolien “Biopharmazeutika” (Finnisch)

Finnischsprachiges Lernmaterial

Grundlagen der Biopharmazeutika

Titel: Biologiset lääkkeet (Biopharmazeutika) Jahr: 2016 Autor: Fimea (Finnische Agentur für Arzneimittel und Medizinprodukte) URL: https://fimea.fi/laaketurvallisuus_ja_tieto/biologiset-laakkeet
Titel: Biologiset lääkkeet (Biopharmazeutika) Jahr: 2023 Autor: Terveyskylä (Öffentlicher Informationsdienst, der u.a. von den finnischen Universitätskliniken bereitgestellt wird) URL: https://www.terveyskyla.fi/laaketalo/tietoa-laakkeista/biologiset-laakkeet

Grundlagen der Biosimilars

Englisch oder Finnisch?

Wed, 26 Mar 2025 00:00:00 +0000

Ich unterrichte Bachelor-, Master- und PhD-Studierende an der Universität Helsinki . Während fast alle Master- und PhD-Arbeiten in den Biowissenschaften auf Englisch verfasst werden, diskutiere ich mit Bachelor-Studierenden immer die Frage, ob sie ihre Arbeit auf Finnisch oder Englisch schreiben sollten. Ich komme sowohl mit Finnisch als auch mit Englisch gut zurecht, aber wenn man eine Entscheidung treffen muss, sollte man ein paar Dinge bedenken:

„Biologische Arzneimittel“ auf Finnisch unterrichten

Fri, 01 Nov 2024 00:00:00 +0000

Der Internationale Masterstudiengang für pharmazeutische Forschung, Entwicklung und Sicherheit (MPHARM) erhielt im Jahr 2022 als Gruppe den Innoopeli-Preis für die Weiterentwicklung der Lehre an der Fakultät für Pharmazie . Als Mitglied des Lenkungsausschusses war ich etwas überrascht, da zu diesem Zeitpunkt noch keiner unserer Studierenden seinen Abschluss gemacht hatte. Das vorzeitige Lob fand jedoch Anfang dieses Jahres seine Bestätigung, als die erste Gruppe von Studierenden ihren Abschluss machte . In diesem Jahr ging der Innoopeli-2024-Preis an Patrick Laurén , Leiter des Studiengangs Pharmazie. Ich erhielt eine „Ehrenauszeichnung“ für meine Lehrtätigkeit . Am meisten überrascht hat mich, dass meine Bemühungen, auf Finnisch zu unterrichten, gewürdigt wurden. Ich habe speziell Finnischkurse besucht, weil ich auf Finnisch unterrichten wollte. Nun habe ich meine Fähigkeiten sogar schon ein paar Mal ausprobiert. Liebe StudentInnen des FARM-310 (Biologische Arzneimittel, Grundkurs) – bitte entschuldigt, denn ich wusste nicht, worauf ich mich da einließ! Das Unterrichten auf Finnisch war eine Herausforderung, aber es klappt mittlerweile einigermassen. Es erfordert von mir jedoch deutlich mehr Vorbereitungszeit als eine Vorlesung auf Englisch. Ich möchte mich auch bei meinen Fiinnischlehrern Emmi, Yrjö und Taija bedanken! Das Wichtigste war vielleicht eure Unterstützung trotz meiner schwachen Leistung. Ich habe einen Videobeweis für meinen schwachen ersten Versuch, aber ich werde langsam besser. Hier sind die Links zu den finnisch- und englischsprachigen Vorlesungsfolien (nach drei Jahren der Überarbeitung sollten sie eigentlich in Ordnung sein, aber meldet euch gerne, falls ihr sprachliche oder inhaltliche Fehler findet):

Aufnahmeinterview

Thu, 09 May 2024 00:00:00 +0000

Immer mehr Masterstudiengänge an unserer Universität integrieren ein Vorstellungsgespräch in das Zulassungsverfahren. Tiina Immonen vom TRANSMED-Studiengang war die Vorreiterin an der Universität Helsinki, die sich als Erste auf dieses Terrain gewagt hat. Wenn du zu einem Vorstellungsgespräch an der Universität Helsinki eingeladen wirst, hast du bereits die größte Hürde genommen, nämlich die Bewertung Ihrer Bewerbung. Um angenommen zu werden, musst du im Prinzip bloss darauf achten, das Vorstellungsgespräch nicht zu vermasseln. Du musst nicht herausragend sein, aber du musst die Erwartungen erfüllen. Der Grund dafür ist, dass Vorstellungsgespräche bekanntermaßen schwer zu bewerten sind und daher von vielen Studiengängen in erster Linie dazu genutzt werden, um Studenten mit zuvielen Warnsignalen auszusortieren.

Bio-Rad repariert unser NGC

Wed, 20 Sep 2023 00:00:00 +0000

UPDATE (Stand: 21. Dezember 2024)

Wir haben gerade unseren Kurs zur Proteinreinigung (DPDR-305) hinter uns gebracht (siehe auch meine anderen blog posts über Lehre ). Nachdem wir etwa 25 Aufreinigungen mit dem „reparierten“ Bio-Rad NGC durchgeführt haben, muss ich leider feststellen, dass das größte Problem weiterhin besteht: Das FPLC reagiert nicht mehr auf manuell eingegebene Befehle. Auch die zufälligen Verbindungsabbrüche hielten an. Zwar hatte nur eine Studentengruppe Probleme, doch kam es an diesem einen Tag zu mehreren Vorfällen. Damit endet leider unser kurzer Ausflug in das Bio-Rad-Territorium der Proteinreinigung. All dies deutet darauf hin, dass weitere Investitionen in dieses Gerät reine Zeit- und Geldverschwendung wären. Wir haben weder zu viel Zeit noch zu viel Geld. Wenn Bio-Rad aus eigener Initiative etwas unternehmen möchte, bin ich gerne bereit, ihnen alle notwendigen Maßnahmen zu überlassen, um das Gerät in einen nutzbaren Zustand zu versetzen, aber wir werden keine weiteren Schritte aktiv verfolgen. Der beste Weg, Ihr FPLC-Gerät in gutem Zustand zu halten, ist ein Wartungsvertrag. Obwohl wir in den letzten 30 Jahren zweimal Mittel von unserer Universität erhalten haben, um ein FPLC-Gerät der Spitzenklasse anzuschaffen, ist es viel schwieriger, Mittel für einen Wartungsvertrag zu bekommen. Einer der vielen Gründe dafür ist, dass die meisten Förderzeiträume kürzer sind als Wartungsverträge, die nur dann Sinn machen, wenn sie über mehrere Jahre abgeschlossen werden.

Wie attraktiv ist Finnland für internationale Studierende?

Sun, 29 Aug 2021 00:00:00 +0000

Eine Vorab-Entschuldigung: Alle Links in diesem Beitrag führen zu finnischen Websites, was eines der Probleme verdeutlicht, mit denen ausländische Studierende in Finnland konfrontiert sind: eine Sprache, die keiner anderen europäischen Sprache ähnelt (abgesehen von Estnisch und Ungarisch, die ebenfalls zur finnisch-ugrischen Sprachfamilie gehören). Ausländische Studierende fühlen sich in Finnland im Allgemeinen wohl. Auch wenn nicht alles perfekt ist, ist die Universität Helsinki (und Finnland im Allgemeinen) eine Überlegung wert, wenn man im Ausland studieren möchte. Das ist das Fazit einer Umfrage unter mehr als 800 internationalen Studierenden aus den Jahren 2020 und 2021. Besonders die hohe Qualität der Lehre wurde geschätzt. Weitere Punkte, in denen sich die Universität Helsinki hervorgetan hat, waren das sichere Umfeld und der Umgang mit der Covid-19-Pandemie. Letzteres hat jedoch auch eine Kehrseite, da mehr Begegnungen und Gespräche mit dem akademischen Personal sowie mehr soziale Unterstützung auf der Wunschliste der Studierenden standen. Dies ist kaum überraschend, da internationale Studierende bei ihrer Ankunft im Land nicht auf dieselben Netzwerke zurückgreifen können wie Einheimische. Das größte Einzelproblem schien die Aufnahme der Studierenden zu sein. Die Ankunft und der Umgang mit einer unbekannten und unverständlichen Bürokratie sind für Neuankömmlinge oft zu viel. Diskriminierung wurde nur von 4 % der Befragten erlebt, und unter ihnen waren sprachliche Diskriminierung und Einsamkeit am häufigsten. Ich warne immer Studierende, die mir erzählen, dass sie sich an der Universität Helsinki bewerben wollen. Ihr wollt eine ehrliche Meinung dazu, ob ihr euer Studium in Finnland beginnen sollt? Okay: Es kann ziemlich kalt werden, und im Winter wird es WIRKLICH dunkel. Dennoch ist Helsinki in der kalten und dunklen Jahreszeit immer noch einer der lebenswerteren Orte. Die Temperaturen fallen selten unter 0°F (-17,8°C), und da die Stadt an der Südküste liegt, ist sie auch einer der Orte, an denen es am wenigsten dunkel ist. Und die globale Erwärmung tut ihr Bestes, um die Temperaturen zu erhöhen. Finnland ist bereits der Geheimtipp für langfristige Immobilieninvestitionen: noch günstig genug, aber mit extremem Wachstumspotenzial, sobald der Klimawandel Südeuropa in einen Schmelzofen verwandelt. Allerdings werden sich diese Szenarien erst dann vollständig verwirklichen, wenn die derzeitigen politischen Entscheidungsträger bereits das Zeitliche gesegnet haben. Wenn Sie jedoch auf lange Sicht denken, könnte Finnland DER Ort sein, an dem man sein sollte. Aber noch einmal: Sollte der Golfstrom zusammenbrechen, sind Sie wieder ganz am Anfang. Dank deinen Eltern für das Chaos, das sie dir hinterlassen haben ( https://www.theguardian.com/environment/2021/aug/05/climate-crisis-scientists-spot-warning-signs-of-gulf-stream-collapse ).So gut Finnland zum Studieren auch sein mag – sich dauerhaft dort niederzulassen, ist leider eine ganz andere Geschichte. Auch wenn Finnland die Einwanderung ankurbeln muss, um den Bevölkerungsrückgang und die Überalterung auszugleichen, gibt es leider immer noch zu viele Hürden zu überwinden, bevor eine Niederlassung für die meisten Ausländer zu einer realistischen Option wird. Die Sprache ist nur eine davon; weitere werden in einem aktuellen Artikel in der größten finnischen Tageszeitung (Helsingin Sanomat) die Schwierigkeiten bei der Integration in die finnische Gesellschaft, die für Ausländer unverständliche Bürokratie und das niedrige Lohnniveau. Aber auch die wachsende Ablehnung gegenüber Ausländern in der finnischen Bevölkerung, die sich im Erfolg der „Finns-Partei“ (früher bekannt als „Wahre Finnen“) manifestiert, ist nicht gerade hilfreich. Auch die meisten anderen europäischen Länder haben mit rechten politischen Strömungen zu kämpfen. In meinem Heimatland Deutschland wird die AfD (die in etwa der Finns-Partei entspricht) von keiner der demokratischen Parteien als möglicher Koalitionspartner angesehen (Wunschdenken meinerseits?). Hier in Finnland hingegen war die Finns-Partei bereits Teil einer Koalitionsregierung, und nur die Sozialdemokraten und die linke Koalition vertreten in dieser Frage eine klare „Nein“-Haltung.Erst kürzlich äußerte sich der neu gewählte Bürgermeister von Helsinki, Juhana Vartiainen, zur Attraktivität des finnischen Arbeitsmarktes für Ausländer: „Ein kläglicher Misserfolg seitens Finnlands. Das politische Bewusstsein hat sehr lange gebraucht, um überhaupt zu begreifen, dass wir Arbeitsmigration überhaupt brauchen.“ ( Helsingin Sanomat, 28.08.2021 ). Aber davon abgesehen ist das akademische Lehrangebot auf sehr hohem Niveau. Und sie ist für Einwohner der EU/EFTA (sowie für Inhaber entsprechender Abschlüsse aus diesen Ländern) kostenlos. Für zahlende Studierende sind die Studiengebühren im Vergleich zu vielen anderen Universitäten derselben Kategorie ein Schnäppchen (zwischen 13.000 und 18.000 Euro pro Jahr, je nach Studiengang). Allerdings wird das Universitätspersonal einen hohen Preis zahlen müssen, um diese Qualität aufrechtzuerhalten. Für das aktuelle Jahrzehnt (2020–2030) hat sich das Bildungsministerium zum Ziel gesetzt, die Zahl der abgeschlossenen Hochschulabschlüsse um 100.000 zu erhöhen ( https://www.acatiimi.fi/4_2021/15.php ). Gleichzeitig wurden die Hochschulbudgets gekürzt. Die Regierung wird diese Kürzungen wahrscheinlich durch eine medienwirksame „Rettet die Universität“-Kampagne kompensieren, um davon abzulenken, dass wir zusätzlich Dutzende Millionen benötigen, um in den kommenden Jahren für diese 100.000 zusätzlichen Abschlüsse das gleiche hohe Lehrniveau zu gewährleisten. Auf der Forschungsebene kämpft das wissenschaftliche Personal seit 2005, als das inflationsbereinigte Budget für Forschung und Entwicklung zum ersten Mal sank, einen harten Kampf. Inzwischen spüren jedoch auch die Studierenden den Mangel an ausreichender Finanzierung, z. B. wenn ihre Lehrenden einfach nicht mehr so viel Zeit für sie haben wie früher. Ich habe keine andere Wahl, als den Studierenden generell von einer akademischen Laufbahn abzuraten. Die meisten anderen europäischen Länder haben ähnliche Probleme, wenn auch vielleicht nicht in demselben Ausmaß wie Finnland. Und die Studierenden wissen, dass die Finanzierung der Wissenschaft in Finnland besonders schlecht ist .

TuKoKe-Erfolg für TET-Praktikanten

Wed, 09 Jun 2021 00:00:00 +0000

In Finnland absolvieren Schüler der 8. oder 9. Klasse ein ein- oder zweiwöchiges Praktikum zur Einweisung in das Berufsleben (TET) an einem Arbeitsplatz ihrer Wahl. Die Covid-19-Pandemie hat auch diesen Bereich grundlegend durcheinandergebracht, doch unserem Labor gelang es dennoch, im Herbst einige Praktikanten aufzunehmen, als die Covid-19-Zahlen relativ niedrig waren.Eine Gruppe, bestehend aus Pessi Baski, Rasmus Pouta und Okko Siljander von der Grundschule Käpylä, führte ein TET-Projekt mit dem Titel Können im 3D-Druck aus recycelten Kunststoffmaterialien hergestellte Behälter für die Zellkultivierung verwendet werden? Unter der Leitung von Niklas Koppatz nahmen sie mit diesem Projekt am landesweiten TuKoKe (Forschen-Experimentieren-Entwickeln)-Wettbewerb für Wissenschaft und Technologie teil und gewannen nicht nur den dritten Preis , sondern auch den Produktpreis der Design Factory der Aalto-Universität sowie ein Stipendium der Erfinderstiftung für Arbeiten mit erfinderischen Merkmalen. Herzlichen Glückwunsch!

Unsere erste OER (Open Educational Resource)

Wed, 03 Feb 2021 00:00:00 +0000

Als ich meine neue Stelle an der Fakultät für Pharmazie antrat, war klar, dass ich mehr formalen Unterricht halten würde als zuvor. Auch wenn ich bereits zuvor Vorlesungen gehalten habe, habe ich dabei in der Regel lediglich einen Konferenzvortrag angepasst, in dem ich die Forschungsarbeit unseres Labors vorgestellt habe. Für Bachelor-Studierende reicht das jedoch nicht aus, weshalb ich meine Vorlesungen nun von Grund auf neu zusammenstelle. Obwohl viel von „Open Science“ die Rede ist, gibt es für die Themen, die ich unterrichte – Gen- und Protein-Engineering, Proteinwirkstoffe, Biologika –, kaum oder gar keine offenen Bildungsressourcen. Da ich der Meinung bin, dass es mehr frei zugängliches Lehrmaterial geben sollte, habe ich beschlossen, meine Vorlesungen frei zugänglich zu machen. Mir wurde jedoch schnell klar, dass es sehr schwierig ist, urheberrechtlich geschütztes Material durch freie Alternativen wie Public Domain oder unter einer Creative-Commons-Lizenz lizenziertes Material zu ersetzen. 80 % der Bilder und Illustrationen lassen sich leicht ersetzen, die nächsten 15 % kosten genauso viel Zeit wie die ersten 80 %, und für die letzten paar Bilder scheint es unmöglich, urheberrechtsfreie Alternativen zu finden. Letztendlich habe ich den Löwenanteil des Materials selbst erstellt. Für diese konkrete Vorlesung habe ich kein brauchbares Bild von Judah Folkman gefunden. Natürlich könnte ich, wenn Geld keine Rolle spielen würde, einfach eines für ein paar hundert Dollar kaufen, aber es wäre dennoch nicht möglich, dass andere es wiederverwenden könnten. Als vorübergehende Lösung habe ich selbst ein Bild gezeichnet. Ich kann nicht gut zeichnen, helft mir bitte, wenn ihr könnt! Heute habe ich endlich meine erste Vorlesung in die Library of Open Educational Resources hochgeladen: https://aoe.fi/#/materiaali/1212 . Es handelte sich um eine Einführungsvorlesung zum Thema Entdeckung und Entwicklung von Proteinwirkstoffen für Bachelor-Studierende der Pharmazie (Kurs PROV-105), die am 9. September 2020 gehalten wurde. Die „Library of Open Educational Resources“ wird vom finnischen Bildungsministerium gepflegt. Außerdem habe ich einen Eintrag in die Merlot-Sammlung (die wohl der größte OER-Katalog ist) vorgenommen: https://www.merlot.org/merlot/viewMaterial.htm?id=773405613.Allerdings bin ich mit der Situation nicht ganz zufrieden, da ich die Vorlesung mit Google Slides vorbereitet habe. Warum Google Slides? Leider ist dies die einzige funktionierende Software für die gemeinsame Bearbeitung von Präsentationen in Echtzeit. Aus diesem Grund ist die Originalversion der Vorlesungsfolien nicht auf aoe.fi verfügbar. Es gibt jedoch einen Link zu den Google Slides. Selbstverständlich habe ich dieselbe Präsentation nach der Konvertierung im PDF- und ODF-Format sowie alle bearbeitbaren Quelldateien (größtenteils im SVG-Format) beigefügt. Und sollte die gemeinsame Online-Bearbeitung von LibreOffice endlich nutzbar werden, werden wir wahrscheinlich auf diese umsteigen und Google Slides nicht mehr verwenden. Die Live-Online-Version ist die nützlichere Ressource. Abgesehen davon, dass es sich hierbei um die Originalversion der Präsentation handelt, wird sie auch regelmäßig aktualisiert (da ich diesen Vortrag wiederholt halten werde), während die hochgeladene PDF-/ODF-Datei mit der Zeit immer mehr veralten wird.UPDATEIch habe es inzwischen geschafft, eine weitere Vorlesung auf https://aoe.fi hochzuladen. Alle meine zukünftigen Beiträge werden auf meiner Sammelseite verfügbar sein.* *

Bearbeitung der Zoom-Aufzeichnungen von Online-Unterricht mit FFmpeg

Wed, 25 Nov 2020 00:00:00 +0000

Basierend auf dem Feedback der Studierenden haben wir einen neuen Kurs für das TRANSMED MSc-Programm über Arzneimittelentwicklung organisiert. Es ist das, was man im Deutschen einen “Schnupperkurs” nennt. Ich habe nie eine zufriedenstellende Übersetzung dieses Wortes ins Englische gefunden. Es bedeutet, dass wir lediglich das Interesse der Studenten an diesem Thema wecken wollen. Wenn er ihnen gefällt, können sie einen der vielen vertiefenden Kurse belegen, die z.B. an der Pharmazeutischen Fakultät angeboten werden, wo es in den kommenden Jahren aufgrund des geplanten internationalen MSc-Programms in Pharmazie mehr Unterricht auf Englisch geben wird.

Als Wissenschaftler nach Finnland?

Mon, 26 Oct 2020 00:00:00 +0000

Wenn man daran denkt, als Student oder als Wissenschaftler ins Ausland zu gehen, dann fallen einem als ersten die Angloamerikanischen Länder ein. Obwohl deren Anziehungskraft immer noch sehr stark ist, haben sie in letzter Zeit an Attraktivität eingebüsst. Im kontinentalen Europa zu bleiben, ist nicht mehr zwangsläufig eine Sackgasse für die Karriere. Finnland ist diesbezüglich sicherlich nicht die erste Wahl unter den potentiellen europäischen Zielen.Trotzdem hat sich - besonders unter StudentInnen - Finnland die Position eines Geheimtipps erarbeitet. Unter den Austausch-Studenten stellen übrigens die deutschen die grösste Gruppe, gefolgt von französischen, spanischen, niederländischen und italienischen StudentInnen. Die meisten unter ihnen kommen über das Erasmus-Program der Europäischen Union nach Finnland Ich habe vor kurzem einen Gastbeitrag auf dem Blog Claudias Helsinki darüber geschrieben, ob es sich lohnt, als Wissenschaftler nach Finnland zu kommen. Das Fazit kann in einem Satz zusammengefasst werden : Es gibt einige wissenschaftliche Bereiche, in denen Finnland Spitzenforschung betreibt.Darüberhinaus bieten finnische Universitäten zunehmend internationale MSc und PhD Studienprogramme an. Für die MSc Studiengänge wird eine Studiengebühr erhoben. Wer jedoch aus einem EU-Land kommt (oder wer sich mit einem Abschluss aus einem EU-Land bewirbt), der ist von der Studiengebühr befreit.Hier z.B. die Links zu den MSc- und PhD-Programmen, die an der Universität Helsinki angeboten werden:https://www.helsinki.fi/de/admissions/explore-our-international-masters-programmeshttps://www.helsinki.fi/de/research/doctoral-education/doctoral-schools-and-programmes

Praktikum: Aufreinigung und Charakterisierung rekombinanter Proteine (DPBM-135)

Sun, 10 Dec 2017 00:00:00 +0000

Unterrichtsmaterialien, Ergebnisse usw. für den DPBM-Kurs „Aufreinigung und Charakterisierung rekombinanter Proteine“ ( https://courses.helsinki.fi/en/DPBM-135/120171139 ):

Aufreinigung und Charakterisierung rekombinanter Proteine

Mon, 20 Mar 2017 00:00:00 +0000

Wir organisieren (erneut) einen praxisorientierten Kurs zur Proteinreinigung vom 4. bis zum 20. Dezember. Wir können maximal 16 Teilnehmer aufnehmen, die in Gruppen von 2 bis 4 Teilnehmern eingeteilt werden. Jede Gruppe benötigt drei volle Tage, um die praktischen Übungen durchzuführen, wobei sich der dritte Tag des Kurses mit dem ersten Tag der nächsten Gruppe überschneidet. Veranstaltungsort ist das Biomedicum Helsinki, Räume A516a1 (wo sich die Geräte befinden) und B318a/b (unser Labor). Wir werden ein Protein (VEGF-Rezeptor 3) mithilfe eines zweistufigen Protokolls (Affinitätschromatographie + Gelfiltration) auf dem Äkta Avant FPLC-Gerät aufreinigen. Am dritten Kurstag werden wir die Wechselwirkung dieses Proteins mit seinem Liganden (VEGF-C) auf dem ITC-Gerät (isotherme Kalorimetrie) untersuchen. Wir haben bereits 2015 einen ähnlichen Kurs angeboten ( http://www.helisci.fi/hbgs/FPLC2015/) . Dieser neue Kurs ( https://courses.helsinki.fi/en/DPBM-135/120171139 ) wird einen ähnlichen Aufbau haben, wir erweitern ihn jedoch um einen Tag, um Protein-Wechselwirkungen mithilfe des neuen Isothermischen-Kalorimetrie-Geräts unserer B3P-Kernanlage zu analysieren. Die Dokumentation und die Ergebnisse werden ebenfalls hier verfügbar sein.Da wir maximal zwei Proben gleichzeitig bearbeiten können (wir verfügen „nur“ über zwei FPLC-Geräte), müssen wir die Teilnehmer in Gruppen (mit jeweils 2–4 Studierenden) aufteilen und den dreitägigen Kurs je nach Teilnehmerzahl mehrmals wiederholen.

Cloning-Club – Workshop-Material

Tue, 30 Aug 2016 00:00:00 +0000

Sammlung der Kursunterlagen für den von DPBM organisierten Cloning Club zusammengestellt. Für jede Vorlesung gibt es Dateien in (mindestens) zwei verschiedenen Formaten: PDF und ODP (Open Document Presentation). Die ODP-Datei lässt sich mit der Software LibreOffice bearbeiten. Wenn Sie sie mit Microsoft Office öffnen möchten, müssen Sie sie zunächst entweder mit LibreOffice oder einem Online-Konvertierungstool (wie cloudconvert ) konvertieren. Das Material des Kursveranstalters (im Open-Document- und PDF-Format) steht unter der Creative-Commons-Lizenz zur Verfügung (ausgenommen ist angepasstes Material, das ausdrücklich gekennzeichnet ist). Materialien der Kursteilnehmer (im PowerPoint-Format) werden zu den Bedingungen der Urheber bereitgestellt. Möglicherweise füge ich später auf Grundlage des Feedbacks der Teilnehmer verbesserte Versionen der Präsentationsfolien für die Treffen bzw. Vorlesungen hinzu.

Klonier-Club

Wed, 22 Jun 2016 00:00:00 +0000

Gemeinsam mit dem Doktorandenprogramm für Biomedizin (DPBM) organisieren wir im Herbst 2016 einen Workshop und einen Praxiskurs zum Thema Klonieren (Kurscode 921244).Termine und Veranstaltungsort (Workshop): Wöchentlicher Diskussionsworkshop (8 Termine à 1 bis 1,5 Stunden) ab Dienstag, 30.8.2016; Veranstaltungsort: Besprechungsraum 7 (Biomedicum Helsinki, 5. Stock, außer am 27.09. und beim letzten Workshop am 25.10., die in BM B136A stattfinden); 1 KreditpunktTermine und Veranstaltungsort (Praktikum): Dezentraler Laborkurs (nach Zeitplan und am Veranstaltungsort der Teilnehmenden oder – für Teilnehmende ohne eigenen Zugang zu den erforderlichen Einrichtungen – in den ersten beiden Novemberwochen in unserem Labor); 1 KreditpunktKursinformationsseite: http://www.helisci.fi/hbgs/cloning-club2016 Anmeldeseite: https://elomake.helsinki.fi/lomakkeet/71701/lomake.html Detaillierte Kursinformationen: PDF Werbeplakat: PDF Kursmaterial: Das Material wird nach jedem Treffen hier hinzugefügt . Das Klonieren hat den Reiz, langweilig zu sein. Doch alles beginnt mit der DNA. Die Gentechnik ist nicht mehr wegzudenken, und wird auch zukünftig immer wichtiger werden: Wir kratzen gerade erst an der Oberfläche ihres Potenzials. Fast die gesamte biomedizinische Forschung befasst sich mit DNA-Konstrukten: Expressionsvektoren zur Transfektion von Zellen, Shuttle-Plasmide zur Herstellung von Viren, Konstrukte zur Erzeugung transgener Tiere. Die Fähigkeit, ein DNA-Konstrukt zu erstellen, wird noch benötigt, bis das versprochene Gerät auf den Markt kommt, das jedes Plasmid innerhalb weniger Stunden ausspuckt, nachdem man ihm die Plasmidsequenz eingegeben hat. Es stehen viele neue Technologien zur Verfügung, und daher ist die Auswahl schwieriger als früher, als das Klonieren mit Restriktionsenzymen die einzige Option war. Heute sind die Anforderungen und Möglichkeiten endlos, und man muss die richtige Strategie wählen, um Erfolg und Geschwindigkeit zu maximieren.

2-wöchiger Laborkurs

Tue, 30 Dec 2014 00:00:00 +0000

Ich hatte keine Ahnung, wie viel Arbeit es macht, einen praktischen Laborkurs zu organisieren. Hätte ich das gewusst, hätte Pirjo es viel schwerer gehabt, mich davon zu überzeugen, diesen Kurs für das DPBM-Graduiertenkolleg zu veranstalten. Kari hatte mich gewarnt… Der dazugehörige Vorlesungskurs hatte von September bis November stattgefunden. Der Praktikumskurs war mit 16 freien Plätzen ausgeschrieben worden, doch das war völlig unrealistisch, da wir auf meine 23,7 Quadratmeter Laborfläche beschränkt waren. Es gibt zwar Lehrlaborräume, aber ohne die Ausrüstung und die gesamte sonstige Infrastruktur, die für ein solches Vorhaben erforderlich ist. Acht Personen hatten sich für den Praktikumskurs angemeldet, und – glücklicherweise – sprang die Hälfte davon in letzter Minute ab, da sie sich der hohen Arbeitsbelastung, die der Kurs erforderte, nicht in ausreichendem Maße widmen konnten. So blieben schließlich vier Studierende und drei Projekte übrig. Mit mehr hätten wir es auf keinen Fall geschafft. Die Idee war, jedem Teilnehmer die Möglichkeit zu bieten, sein eigenes Projekt zur DNA-Klonierung und Proteinexpression zu realisieren – etwas, das für sein eigenes Promotionsstudium relevant wäre. Zu diesem Zweck hatte ich einen Monat im Voraus Besprechungen mit den drei Gruppen, um die Klonierung zu planen und die notwendigen Materialien zu bestellen. Wir arbeiteten parallel an den folgenden drei Projekten:

Praktische Molekularbiologie und Gentechnik

Mon, 08 Sep 2014 00:00:00 +0000

Sammlung der Präsentationsfolien für den DPBM -Kurs Praktische Molekularbiologie und Gentechnik . Für jede Vorlesung liegen Dateien in (mindestens) zwei verschiedenen Formaten vor: PDF und ODP (Open Document Presentation). Die ODP-Datei lässt sich mit der Software LibreOffice bearbeiten. Wenn Sie sie mit Microsoft Office öffnen möchten, müssen Sie sie zunächst entweder mit LibreOffice oder einem Online-Konvertierungstool (wie cloudconvert ) konvertieren. Das gesamte Material steht unter der Creative-Commons-Lizenz zur Verfügung. Möglicherweise werde ich später auf Grundlage des Feedbacks der Teilnehmer verbesserte Versionen der Vorlesungsfolien hinzufügen. Die Folie über Restriktionsenzyme (REs) und die Berechnung der erforderlichen RE-Mengen zum Verdauen einer bestimmten DNA-Menge befindet sich in der Datei zu Vorlesung 1.

Privatdozent

Wed, 04 Jan 2012 00:00:00 +0000

Seit dem 13 Dezember 2011 bin ich Privatdozent (auf Finnisch: dosentti ) an der Universität Helsinki. Privatdozent ist keine Stelle, sondern ein Titel, der ein gewisses Mindestmass an wissenschaftlichen Erfolgen nach Abschluss der Doktorarbeit und Lehrerfahrung vorausetzt ( mehr darüber in Finnisch ).

Wie man „Adjunct Professor“ („dosentti“) an der Universität Helsinki wird

Wed, 04 Jan 2012 00:00:00 +0000

Im Vergleich zur Promotion war diese „Dosentti“-Sache ein Kinderspiel. Ich habe Anfang 2011 damit begonnen und den Titel noch im selben Jahr, im Dezember, erhalten. Ich weiß nicht, ob sich das Verfahren an verschiedenen finnischen Universitäten unterscheidet und ob einige der Formalitäten möglicherweise spezifisch für die Universität Helsinki sind, aber dennoch liste ich im Folgenden die Schritte auf, die ich unternommen habe, um den Titel zu erhalten. Anleitungen sind auch hier verfügbar.

Einführung in die Lymphforschung

Thu, 20 Oct 2011 00:00:00 +0000

Vorlesung 1: Das Herz-Kreislauf-System im Vergleich zum Lymphsystem: Anatomie und Physiologie
Vorlesung 2: Molekularer Aufbau des Lymphsystems
Vorlesung 3: Das Lymphsystem bei Erkrankungen
Vorlesung 4: Modellorganismen in der Lymphforschung , .tex file
Vorlesung 5: Grundlegende Techniken in der Lymphforschung
Vorlesung 6: Aktuelle Fragestellungen in der Lymphforschung

Lagerung und Handhabung von Proteinen

Wed, 22 Oct 2008 00:00:00 +0000

Tyrosinkinase-Rezeptoren

Sun, 07 Apr 2002 00:00:00 +0000