Klonier-Club

Wed, 22 Jun 2016 00:00:00 +0000

Gemeinsam mit dem Doktorandenprogramm für Biomedizin (DPBM) organisieren wir im Herbst 2016 einen Workshop und einen Praxiskurs zum Thema Klonieren (Kurscode 921244).Termine und Veranstaltungsort (Workshop): Wöchentlicher Diskussionsworkshop (8 Termine à 1 bis 1,5 Stunden) ab Dienstag, 30.8.2016; Veranstaltungsort: Besprechungsraum 7 (Biomedicum Helsinki, 5. Stock, außer am 27.09. und beim letzten Workshop am 25.10., die in BM B136A stattfinden); 1 KreditpunktTermine und Veranstaltungsort (Praktikum): Dezentraler Laborkurs (nach Zeitplan und am Veranstaltungsort der Teilnehmenden oder – für Teilnehmende ohne eigenen Zugang zu den erforderlichen Einrichtungen – in den ersten beiden Novemberwochen in unserem Labor); 1 KreditpunktKursinformationsseite: http://www.helisci.fi/hbgs/cloning-club2016 Anmeldeseite: https://elomake.helsinki.fi/lomakkeet/71701/lomake.html Detaillierte Kursinformationen: PDF Werbeplakat: PDF Kursmaterial: Das Material wird nach jedem Treffen hier hinzugefügt . Das Klonieren hat den Reiz, langweilig zu sein. Doch alles beginnt mit der DNA. Die Gentechnik ist nicht mehr wegzudenken, und wird auch zukünftig immer wichtiger werden: Wir kratzen gerade erst an der Oberfläche ihres Potenzials. Fast die gesamte biomedizinische Forschung befasst sich mit DNA-Konstrukten: Expressionsvektoren zur Transfektion von Zellen, Shuttle-Plasmide zur Herstellung von Viren, Konstrukte zur Erzeugung transgener Tiere. Die Fähigkeit, ein DNA-Konstrukt zu erstellen, wird noch benötigt, bis das versprochene Gerät auf den Markt kommt, das jedes Plasmid innerhalb weniger Stunden ausspuckt, nachdem man ihm die Plasmidsequenz eingegeben hat. Es stehen viele neue Technologien zur Verfügung, und daher ist die Auswahl schwieriger als früher, als das Klonieren mit Restriktionsenzymen die einzige Option war. Heute sind die Anforderungen und Möglichkeiten endlos, und man muss die richtige Strategie wählen, um Erfolg und Geschwindigkeit zu maximieren.

SnapGene – Einfach die beste Software zur DNA-Bearbeitung

Fri, 01 Jan 2016 00:00:00 +0000

Unser Labor nutzt verschiedene Softwarepakete zur Planung, Dokumentation und Visualisierung von DNA-Konstrukten. Zu den Programmen, die uns lange Zeit sehr gut gefallen haben, gehörten das GeneConstructionKit (GCK) und Clone Manager (Professional) . Letzteres läuft leider nur unter Windows. Da jedoch mehrere unserer Computer mit Ubuntu Linux betrieben werden, haben wir die GCK-Versionen 2.5 und 3 mithilfe von WINE (eine Kompatibilitätsschicht, die es uns ermöglicht, native Windows-Programme unter Linux auszuführen). Mit dem Upgrade auf Version 4 wurde GCK unter WINE jedoch unbrauchbar langsam, sodass wir nach einem Ersatz suchten. Wir haben die Entwickler von GCK kontaktiert, aber diese waren offenbar weder bereit noch in der Lage, uns zu helfen. Ich vermute, dass der Quellcode von GCK wahrscheinlich mehr als 20 Jahre alt ist und sich aus diesem Grund niemand traut, ihn anzurühren. Genau zu dieser Zeit wurde SnapGene veröffentlicht, das fast alle unsere Anforderungen erfüllte:

Plasmide on Michael’s Domain

Klonier-Club

SnapGene – Einfach die beste Software zur DNA-Bearbeitung