https://jeltsch.org/fi/tags/geneconstructionkit/Recent content in GeneConstructionKit on Michael’s DomainHugofiCopyright © 2002 - 2026 Michael Jeltsch.Fri, 24 Jul 2026 00:18:18 +0300https://jeltsch.org/fi/wine_regression_testing/Sun, 30 Nov 2008 00:00:00 +0000https://jeltsch.org/fi/wine_regression_testing/<p>Käytän <a href="http://www.textco.com" target="_blank" rel="noopener noreferrer nofollow">Textco&nbsp; <svg class="svg-inline--fa fas fa-up-right-from-square fa-2xs" fill="currentColor" aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 512 512" overflow="visible"><use href="#fas-up-right-from-square"></use></svg></a> :n Gene Construction Kit -ohjelmaa (versio 2.5) DNA-vektori-karttojen piirtämiseen. Valitettavasti tämä yritys ei välitä Linux-käyttäjistä. Siksi joudun käyttämään WINE:tä Windows-version ajamiseen. Voisin tietenkin käyttää VMware:tä, VirtualBoxia tai Parallelsia, mutta onko se tarpeen vain pienen ohjelman ajamiseksi? Valitettavasti joko Gene Construction Kit (GCK) ei ole koodattu standardien mukaisesti tai WINE ei vieläkään pysty tarjoamaan täyttä yhteensopivuutta, mutta silloin tällöin WINE-päivitys aiheuttaa sen, että ohjelma ei enää toimi. Siksi jouduin turvautumaan regressiotestaukseen löytääkseni version, joka vielä toimii GCK:n kanssa. Tässä on komentoluettelo ja mitä tein:<code>cdmkdir winecvs -z 3 -d :pserver:cvs@cvs.winehq.org:/home/wine checkout wine (salasana 'cvs')cvs update -PAd -D&quot;2007-06-01 CDT&quot;./configuremake dependmakesudo make install</code>Edellä mainitun päivämäärän lähdekoodi on uusin, joka näyttää toimivan.</p>https://jeltsch.org/fi/how_do_i_run_the_gene_construction_kit_under_linux/Sat, 26 May 2007 00:00:00 +0000https://jeltsch.org/fi/how_do_i_run_the_gene_construction_kit_under_linux/<p>On vain muutamia Mac- tai Windows-ohjelmia, joille ei ole hyvää vastinetta Linuxissa. Yksi näistä harvoista on <a href="http://www.textco.com" target="_blank" rel="noopener noreferrer nofollow">Textcon&nbsp; <svg class="svg-inline--fa fas fa-up-right-from-square fa-2xs" fill="currentColor" aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 512 512" overflow="visible"><use href="#fas-up-right-from-square"></use></svg></a> Gene Construction Kit (GCK). GCK on saatavilla sekä Windowsille että Macille. Sen pitäisi siis olla mahdollista ajaa i86-Linux-koneella Wine-ohjelmiston (eräänlainen emulaattori) avulla. Yritin sitä, mutta epäonnistuin (en tosin yrittänyt kovin kovasti). Luultavasti mikä tahansa Windows-ohjelma voidaan kuitenkin ajaa Linuxissa <a href="http://www.vmware.com/" target="_blank" rel="noopener noreferrer nofollow">VMware&nbsp; <svg class="svg-inline--fa fas fa-up-right-from-square fa-2xs" fill="currentColor" aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 512 512" overflow="visible"><use href="#fas-up-right-from-square"></use></svg></a> -ohjelmiston avulla. Valitettavasti VMware on kaupallinen ja kallis (mutta siitä on saatavilla täysin toimiva, ajallisesti rajoitettu demoversio). GCK toimii ongelmitta VMware 4.0:n, W2K:n ja RedHat 9:n alla. Ainoa pettymys VMware:ssä on ”Shared Folders” -vaihtoehto. On paljon parempi jakaa Linuxin kotihakemisto Samban kautta ja saada se automaattisesti kiinnitettynä, kun kirjaudut emuloituun Windows-käyttöjärjestelmään. Onnistuin jopa piilottamaan kotihakemistostani Linux-spesifiset tiedostot, joiden nimi alkaa pisteellä (kuten .mozilla), lisäämällä rivin ”hide dot files = yes” Samba-määritystiedostoon /etc/samba/smb.conf. Vaikka käytän tällä hetkellä VMwarea, aion siirtyä <a href="http://www.winehq.org" target="_blank" rel="noopener noreferrer nofollow">Wineen&nbsp; <svg class="svg-inline--fa fas fa-up-right-from-square fa-2xs" fill="currentColor" aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 512 512" overflow="visible"><use href="#fas-up-right-from-square"></use></svg></a> välttääkseni kaikenlaista Microsoftin koodia.</p>