Muokkaus on Michael’s Domain

Proteiinien puhdistus Äkta- ja Unicorn-järjestelmillä

Sun, 19 Apr 2026 00:00:00 +0000

Proteiinit (ja muut biomolekyylit) puhdistetaan useimmiten kromatografisilla menetelmillä. Vain muutamat valmistajat ovat kehittäneet erityisesti biomolekyyleille, kuten proteiineille, nukleiinihapoille ja viruksille, optimoituja kromatografiajärjestelmiä. Tunnetuimpia järjestelmiä ovat BioRadin NGC-sarja ja Cytivan Äkta-sarja. Tiedekuntamme on hiljattain hankkinut Äkta Avant -laitteiston, ja sen käyttöönotto on aivan loppusuoralla. Se on jo integroitu varausjärjestelmään, ja ainoastaan automaattinen varmuuskopiointijärjestelmä puuttuu vielä. Olen käyttänyt Äkta-laitteita vuodesta 1996 lähtien, jolloin professori Jorma Keski-Oja osti yhden ensimmäisistä Äkta Explorer -laitteistoista Haartman-instituuttiin. Ohjelmistona oli ja on edelleen Unicorn, mutta nykyisin käytössä on versio 7, joka näyttää huomattavasti nykyaikaisemmalta kuin viime vuosituhannen Unicorn-versiot: se on paljon selkeämpi ja vähemmän sekava. Kuitenkaan edes yli 10 vuoden kehitystyön jälkeen Unicorn 7 ei vastaa ominaisuuksiltaan täysin vanhoja versioita. Siksi Evaluation-moduuli tarjoaa mahdollisuuden vaihtaa takaisin Evaluation Classic -näkymään. Jos haluat esimerkiksi esitellä yksilöllisiä ja tyylikkäitä kromatogrammeja luennoillasi, tarvitset edelleen Evaluation Classic -versiota! Vaikka uudessa Evaluation-moduulissa on pikatoimminot käyrien viemiseksi suoraan esitysohjelmiin (kuten PowerPointiin), tämä vienti perustuu täysin pikseligrafiikkaan, eikä kuva ole enää helposti muokattavissa viennin jälkeen. Käyrät kannattaa viedä alan standardimuotoiseen vektorigrafiikkamuotoon: SVG-muotoon. Voit muokata sitä millä tahansa nykyaikaisella vektorigrafiikkaohjelmalla, kuten Canvalla, Adobe Illustratorilla tai Inkscapella. Kun klikkaat hiiren kakkospainikkeella kromatogrammin sisällä Evaluation Classic -näkymässä, voit tallentaa kromatogrammin metatiedostona. Nykyisessä Unicorn-versiossa tämä kuitenkin aiheuttaa virheen Windows 11 -ympäristössä. Ongelman voi kuitenkin kiertää seuraavasti:

Opetussessioiden Zoom-tallenteiden muokkaaminen FFmpegillä

Wed, 25 Nov 2020 00:00:00 +0000

Opiskelijapalautteen perusteella olemme järjestäneet uuden kurssin TRANSMED MSc -ohjelmaan biologisten lääkeaineiden kehityksestä. Se on kurssi, jonka saksaksi kutsutaan nimellä “Schnupperkurs”. En ole koskaan löytänyt tyydyttävää käännöstä tälle sanalle (tutustumiskurssi?). Se tarkoittaa, että haluamme vain herättää opiskelijoiden kiinnostuksen tätä aihetta kohtaan. Jos he pitävät siitä, he voivat osallistua johonkin monista syventävistä kursseista, joita tarjotaan esimerkiksi farmasian tiedekunnassa , jossa englanninkielinen opetus lisääntyy tulevina vuosina huomattavasti suunnitellun kansainvälisen farmasian MSc-ohjelman myötä.

MPEG-elokuvatiedostojen leikkaaminen (mpgtx)

Wed, 04 Apr 2007 00:00:00 +0000

Tallensin televisio-ohjelman dokumentin MPEG-2-muodossa. Jotta voisin jakaa sen internetin kautta, minun on pienennettävä sen kokoa, ja käytän siihen DivX-koodekkia. Mutta ensin halusin leikata alku- ja loppuosat pois. Käytin [mpgtx]-ohjelmaa ( http://mpgtx.sourceforge.net/) , joka on erittäin kätevä komentorivityökalu. Suse-RPM-paketteja on saatavilla Packmanista . Komento oli mpgtx -s tutkittu_juttu.mpg [00:22.50-26:55.00] -o cut.mpg