Staden Package on Michael’s Domain

Staden 2003b:n asentaminen Suse 9:ään

Thu, 24 May 2007 00:00:00 +0000

Lataa lähdekoodit .
Siirry hakemistoon /usr/local ja vaihda käyttäjäksi su.
tar -xvzf /home/jeltsch/Documents/staden_linux_2003.0b1.tar.gz (jeltsch on käyttäjätunnukseni, joten se on korvattava muiden käyttäjien osalta!!!!)

Staden-paketin integrointi työpöytäympäristöön KDE:ssä Suse Linux 9:ssä

Sat, 19 May 2007 00:00:00 +0000

Olen asentanut Staden-paketin kannettavalleni. Jotta voisin saada muut laboratoriossani työskentelevät ihmiset käyttämään sitä, sen on oltava erittäin helppokäyttöinen. Ihannetapauksessa heidän pitäisi vain valita muutama sekvenssi, napsauttaa, ja esikäsittely sekä sekvenssien kokoaminen hoituisivat automaattisesti. Tämän saavuttamiseksi tein seuraavaa:

Kaupunki on MacOS X (ebiotools)

Thu, 05 Apr 2007 00:00:00 +0000

Asensin tänään Staden-paketin Tanjan Macintosh G4 -tietokoneelle (MacOS 10.3). Suosittelen käyttämään Anders Nisterin laatimaa ebiotools-pakettia . Se sisältää muita hyödyllisiä ohjelmistoja, kuten EMBOSS, Blast jne. Asennusohjeet löytyvät embnet-uutislehdistä 9/1, 9/2, 9/3 ja 10/1 tai koottuina yhdeksi PDF-tiedostoksi täältä .