Ubuntu on Michael’s Domain

Zoteron asentaminen Linuxiin/Ubuntuun

Mon, 11 May 2026 00:00:00 +0000

Virallinen tapa asentaa Zotero Linuxiin on lievästi sanottuna painajainen ( https://www.zotero.org/support/installation ). Se tosiasia, että asennuksessa onnistuminen vaatii yksityiskohtaisia ohjeita, puhuu puolestaan:

Sovellus ei vastaa

Fri, 27 Mar 2026 00:00:00 +0000

Gnomessa saat varoituksen, jos sovelluksella kestää liian kauan suorittaa tehtävä. Tämä voi olla todella ärsyttävää, jos tiedät, että sovellus vain yrittää tehdä työnsä käytettävissä olevilla resursseilla. debi, Zotero ja SnapGene ovat joitakin sovelluksista, jotka aiheuttavat usein tämän varoituksen minun (melko hitaalla) kannettavallani. Päästäksesi eroon tästä häiritsevästä varoituksesta (tai ainakin tehdäksesi niistä paljon harvinaisempia), voit pidentää timeoutia näin:

Asustor AS-304T verkkolevypalvelin ei pysty liittämään nykyaikaisia ext4-tiedostojärjestelmiä

Thu, 22 Jan 2026 00:00:00 +0000

Asustore AS-303T on jo melko vanha (vuodelta 2013), mutta halusin silti pitää sen tallentaakseni varmuuskopioita noin viimeisen 15 vuoden ajalta. Olin alun perin asentanut laitteeseen neljä 2 TB:n levyä, mutta nyt minulla oli ylimääräisenä neljä vanhaa 3 TB:n levyä ja halusin käyttää niitä maksimoidakseni tallennuskapasiteetin. Kopioin siis väliaikaisesti tiedot NAS:n RAID-järjestelmästä muutamalle ulkoiselle levylle ennen NAS:n päivittämistä 3 GB:n levyillä. Tein osan kopioinnista suoralla point-to-point-kaapeliyhteydellä kannettavaan tietokoneeseeni , mikä oli huono idea, sillä kun myöhemmin yritin kopioida tietoja takaisin käyttämällä NAS:n paikallista USB3-porttia, NAS:n käyttöjärjestelmä ei tunnistanut ext4-tiedostojärjestelmää, jota Ubuntu 24.04 -järjestelmäni käytti. Kävi ilmi, että Asustor NAS käyttää BusyBox v1.19.3 -versiota, ja vaikka se pystyy lukemaan ext4-tiedostojärjestelmää, se ei tunnista moderneja ext4-ominaisuuksia ja epäonnistui siksi levyjen liittämisessä (Asustor AS-304T käyttää ADM-versio 3.5.9.RWM1, joka sai viimeisimmän päivityksensä 29. elokuuta 2022). Jotta Asustor-käyttöjärjestelmä tunnistaisi nämä levyt, minun oli “alennettava” ext4-tiedostojärjestelmää. Näin se käy:

Ohjeet Asustor AS7004T:n muuntamiseksi Ubuntu-palvelimeksi

Sat, 22 Nov 2025 00:00:00 +0000

Tänä viikonloppuna päivitin vanhan Asustor AS7004T NAS -laitteemme. Nyt se käyttää Ubuntu 24.04 -käyttöjerjestelmän. Vanha ADM-käyttöjerjestelmä ei ollut saanut päivityksiä enää yli vuoteen, ja laite seisoi siitä lähtien sammutettuna hyllyssä. Tämä on sääli, sillä laitteessa ei ollut kerta kaikkiaan mitään vikaa. Olin jo varhaisessa vaiheessa päivittänyt laitteen alkuperäisen 2 Gt:n muistin 8 Gt:n moduulilla yhteensä 10 Gt:n suuruiseksi. Ubuntu-palvelinta voi pyörittää myös 2 Gt:n muistilla, jos todella haluaisi… Mitä muuntamiseen tarvitaan? On sanomattakin selvää, että sinun on kytkettävä laitteeseen USB-näppäimistö ja hiiri. Applen USB-näppäimistöt eivät toimi. Mitä halvempi näppäimistö, sen parempi. Joskus hiiren kanssa oli ongelmia, ja silloin auttoi sen kytkeminen toiseen USB-porttiin. Ja tietysti NAS on liitettävä näyttöön HDMI-kaapelilla. Suosittelen asentamaan Ubuntu Server 24.04.3:n. Myös Ubuntu Desktop 24.03 toimii (testasin sitä), mutta en tarvitse sitä, ja palvelinversion resurssivaatimukset ovat paljon pienemmät. Toisin kuin vanhemmissa Asustorin NAS-laitteissa, tuulettimen ohjaus toimi ongelmitta. LED-ohjaus ja näytön tiedot eivät kuitenkaan toimi: näytössä lukee aina “Starting system. Please wait…”.

Vienti Avidemuxista MP4-muotoon

Sat, 20 Sep 2025 00:00:00 +0000

Jostain syystä Helsingin yliopiston Unitube kaatuu yritettäessä ladata MKV-tiedostoa. Sama toimi vielä viime vuonna… Vain suljetut tiedostomuodot näyttävät olevan ok (kuten MP4). Tämä aiheuttaa minulle paljon lisätyötä, sillä käytän avoimen lähdekoodin työkaluja luentotallenteideni editointiin (lähinnä turhien osien pois leikkaamiseen). MP4-tiedoston luominen edellyttää kuitenkin transkoodausta, mikä on aikaa vievä prosessi ja vaatii monien oletusasetusten muuttamista. Käytän siihen avoimen lähdekoodin ohjelma nimeltä Avidemux:

t_coffee ei edelleenkään pelaa vakio-Ubuntu 24.04 LTS -asennuksen kanssa

Thu, 18 Sep 2025 00:00:00 +0000

t_coffeen bugi, josta on ilmoitettu osoitteessa https://github.com/cbcrg/tcoffee/issues/27#issuecomment-1355339411, on edelleen olemassa monen vuoden jälkeen. Tuskin uskallan suositella t_coffeeta opiskelijoille, vaikka haluaisinkin, koska se on muuten erinomainen ja erittäin tehokas ohjelma. Useimmat eivät onnistu asentamaan sitä yliopistomme Ubuntu-distroon (“Cubbliin”), joka on tällä hetkellä Ubuntu 24.04. Kokeilin sitä itse aivan äskettäin (Ubuntu 24.04 LTS, sekä pakettienhallinnan kautta Ubuntu-paketinhallintalähteestä saatavalla versiolla että stable ja beta-versiolla osoitteesta https://tcoffee.org/Projects/tcoffee/index.html (vakaa COFFEE_installer_Version_13.46.0.919e8c6b_linux_x64.tar.gz ja beta T-COFFEE_installer_Version_13.46.1.b8b01e06_linux_x64.tar.gz). Kaikissa tapauksissa edelleen sama virhe estää ohjelman käyttöä: –ERROR: MAX_N_PID exceeded. Ohjelma jumittuu ja kestää noin minuutin ennen kuin se antaa virheilmoituksen, jopa yksinkertaisessa tehtävässä, joka normaalisti vie vain muutaman sekunnin. Monimutkaisemman alignmentin kohdalla voi kestää minuutteja tai tunteja ennen kuin virhe ilmenee. Kiertotapana on asettaa ympäristömuuttuja ennen jokaista ajokertaa, eli t_coffee korvataan skriptilla, joka kutsuu uudelleennimettyä t_coffeeta sen jälkeen, kun ympäristöparametri MAX_N_PID_4_TCOFFEE on asetettu johonkin suureen arvoon (kuten /proc/sys/kernel/pid_max), ja tämä on selitetty yllä olevassa Github linkissä. Katso myös https://github.com/cbcrg/tcoffee/issues/47 . Toinen kiertotapa on compilata ohjelma uudelleen eri MAX_N_PID-arvolla, mikä on melko suoraviivaista; katso myös täältä https://github.com/cbcrg/tcoffee :

Wireguard

Sat, 30 Aug 2025 00:00:00 +0000

Kotireitittimessäni (GL-iNet GL-MT6000) on sisäänrakennettu WireGuard-tuki. Asiakaslaitteen lisäämiseksi painat painiketta ja voit joko skannata QR-koodin tai ladata asetustiedoston. QR-koodi toimii ilman lisäsäätöjä Wireguard for Android -sovellukseni (virallinen Android-asiakasohjelman) kanssa, ja asetustiedosto toimii yhtä hyvin Ubuntu Linux 24.04:ssä NetworkManagerin kautta. VPN:n määrittämiseksi tuot vain asetustiedoston. Alhaalla viimeisen komennon tarkoitus on estää VPN:n automaattinen käynnistyminen uudelleenkäynnistyksen jälkeen. Jos työskentelen kotona, ei ole juurikaan järkeä liikenteen reitittämisessä oman kodin VPN-palvelimelle, kun olen jo kotona.

DVD-levyjen varmuuskopiointi

Sat, 09 Aug 2025 00:00:00 +0000

DVD-levyjen kopiointi on yksi asia (ja Handbrake on työkalu, jota olen enimmäkseen käyttänyt siihen). Mutta joskus haluat vain kopioida koko DVD:n kiintolevylle. Ubuntu Linuxissa suosikkiohjelmistoni tähän on dvdbackup .

Pythonin virtuaaliympäristöt

Mon, 16 Jun 2025 00:00:00 +0000

Pythonia voi ajaa virtuaaliympäristössä monilla eri tavoilla. Olen tähän asti käyttänyt condaa (yhdessä anacondan kanssa), mutta päädyn usein työskentelemään koneilla, joihin sitä ei ole asennettu. Siksi olen viime aikoina alkanut käyttää “sisäänrakennettua” virtuaaliympäristöä. Jos työstät Python-projektia jossakin hakemistossa, voit aloittaa sen käytön näillä vaiheilla:

Kuinka salata toinen kiintolevy manuaalisesti Ubuntu 20.04:ssä

Fri, 19 Nov 2021 00:00:00 +0000

https://dev-notes.eu/2020/12/LUKS-Encrypt-Hard-Drive-with-Cryptsetup-on-Ubuntu-20.04/Check-levyt : lsblk sudo hdparm -i /dev/sda Käytä parted-komentoa (alle 2 TB:n levyille voidaan käyttää fdisk-komentoa partedin sijaan):sudo parted /dev/sda mklabel gptsudo parted -a opt /dev/sda mkpart primary ext4 0% 100%Luo LUKS-salaus. Tässä vaiheessa sinun on syötettävä salasana, jota käytät levyn salauksen purkamiseen:cryptsetup -y -v luksFormat /dev/sda1Luo väliaikainen kartoitus:sudo cryptsetup luksOpen /dev/sda1 DOCUMENTS (jos et saa virheilmoitusta, olet onnistunut)Tarkista kartoitus: ls -l /dev/mapper/DOCUMENTS sudo cryptsetup -v status DOCUMENTS Tee kartoituksesta pysyvä. Sanan ”none” sijaan voit myös määrittää avaintiedoston (= huomattavasti vähemmän turvallista, jos tiedosto sijaitsee samassa järjestelmässä). /dev/sda1:n sijaan voit myös antaa UUID:n. Ehkä osiota ei edes tarvita, vaan /dev/sda:ta voidaan käyttää suoraan. Voit selvittää UUID:n komennolla “blkid” tai – jos se ei toimi – komennolla “ls -l /dev/disk/by-uuid"DOCUMENTS UUID=e6813be6-1e6e-4c6f-80cf-b47a428a700d none luks,discard Tarkista LUKS-otsikko: sudo cryptsetup luksDump /dev/sda1 Luo tiedostojärjestelmä: sudo mkfs.ext4 /dev/mapper/DOCUMENTS -L “4TB_DOCUMENTS_DISK”

Perl-moduulien asentaminen

Tue, 22 Jun 2021 00:00:00 +0000

En ole tehnyt tätä ehkä kymmeneen vuoteen tai kauemminkin. Mutta ilmeisesti asiat ovat edelleen samat Ubuntu 18.04:ssa:

sudo apt-get install build-essential
cpan
make install
install Bundle::CPAN
install App::GnuplotUtils

Useita Python-versioita Ubuntu 20.04:ssä

Fri, 30 Apr 2021 00:00:00 +0000

Uuden Python-version lisääminen Ubuntu 20.04:ään (minun käyttöjärjestelmälle se on kolmas versio 2.7:n ja 3.8:n jälkeen): sudo update-alternatives --install /usr/bin/python python /usr/bin/python3.6 3

Apache-välityspalvelin

Fri, 31 Jul 2020 00:00:00 +0000

Joka tapauksessa: Mikä on eteenpäin välittävä välityspalvelin (ja mikä on muuten käänteinen välityspalvelin)? Jos välityspalvelin on eteenpäin välittävä, palvelin luulee välityspalvelinta asiakkaaksi. Jos välityspalvelin on käänteinen, asiakas luulee välityspalvelinta palvelimeksi.

Kopiointi rsyncillä

Mon, 17 Feb 2020 00:00:00 +0000

Syitä, miksi rsync:tä kannattaa (ei aina, mutta usein) suosia cp:n sijaan:

Keskeytettyjen siirtojen jatkaminen Jos kopioit suuria tiedomääriä ja terminaalisessio kaatuu tai virta katkeaa, joudut aloittamaan alusta jos käytät cp:tä. rsync voi sen sijan jatkaa juuri siitä, mihin se jäi, mikä voi säästää valtavasti aikaa suurten tietomäärien kohdalla.
Tehokkuus (delta-siirtoalgoritmi) rsync on suunniteltu toimimaan älykkäästi. Jos kopioit tiedostoa, joka on jo olemassa kohdessa (esim. päivität varmuuskopiota), rsync kopioi vain ne tiedoston osat, jotka ovat tosiasiallisesti muuttuneet (”delta”), sen sijaan että se korvaisi koko tiedoston. cp puolestaan kopioi aina koko tiedoston joka kerta.
Reaaliaikainen edistymisen seuranta rsync tarjoaa erinomaista visuaalista palautetta. Käyttämällä -P- (tai –progress-) saat reaaliaikaisen edistymispalkin, joka näyttää valmistumisprosentin, siirtonopeuden ja arvioidun jäljellä olevan ajan. cp on tunnetusti hiljainen, jolloin joudut arvaamaan, onko prosessi vielä käynnissä vai onko se jumiutunut. Toki voit tarkista kohdekansiosta saapuvan tiedoston koon perusteella, eteneekö prosessi lainkaan (ls -lh tiedostonimi tai du -hs tiedostonimi)
Saumattomat etäsiirrot rsync on alun perin suunniteltu toimimaan SSH:n kautta. Sen avulla voit kopioida tiedostoja suoraan etäpalvelimelle tai sieltä pois yhtä helposti kuin kopioisit tiedostoja omalla koneellasi. cp ei pysty tähän; jos haluat käyttää cp:tä etäpalvelimelle, sinun on ensin liitettävä etätiedostojärjestelmä paikallisesti, mikä on paljon monimutkaisempaa ja virhealtisempaa.

Tässä on yleinen käyttötapaus: kansion siirtäminen sen koko sisällön kanssa:

Pysyvä staattinen reitti Ubuntu Karmic Koala (9.10), Precise Pangolin (12.04) ja Trusty Tahr (14.04) -käyttöjärjestelmissä

Sat, 26 Dec 2009 00:00:00 +0000

Karmic Koala Jos haluat lisätä pysyvän staattisen reitin Karmic Koala -järjestelmään, jossa on yksi verkkokortti, sinun on muokattava tiedostoa /etc/network/interfaces. Seuraava osa on korvattava:# Ensisijainen verkkoliitäntäauto eth0#iface eth0 inet dhcpMuokkaa seuraavasti:# Ensisijainen verkkoliitäntäauto eth0iface eth0 inet dhcpup route add -net 10.8.0.0 netmask 255.255.255.0 gw 192.168.0.3down route del -net 10.8.0.0 netmask 255.255.255.0 gw 192.168.0.3**Precise Pangolin (12.04)**Precise Pangolinissa tein tämän lisäämällä /etc/network/if-up.d-kansioon skriptin nimeltä add_route:#!/bin/sh#if [ "$IFACE" = "eth0" ]; then route add -net 10.8.0.0/24 gw 192.168.0.18#fiEn koskaan lisännyt vastaavaa skriptiä (del_route) hakemistoon /etc/if-down.d, mutta se näyttää toimivan hyvin.**Trusty Tahr (14.04)**Trusty Tahrissa lisäsin route-komennon rivinä /etc/rc.local-skriptiin:…route add -net 192.168.1.0/24 gw 192.168.0.3exit 0route-komennon on oltava ennen “exit 0”-riviä!**Mac OS X 10.8 (Mountain Lion)**Ja näin se tehdään Mac OS X 10.8:ssa: http://nellen.it/blog/2012/01/permanent-static-routes-for-mac-os-x . MacOS X:n ohjeet ovat muuttuneet ajan myötä; tässä on ohjeet siitä, miten se tehtiin MacOS X 10.4.7:ssä .

Verkkokorttien (NIC) MAC-osoitteen (Media Access Control) muuttaminen

Sun, 25 Jan 2009 00:00:00 +0000

Joissakin verkoissa tietokoneet on rekisteröitävä, jotta ne voivat yhdistää verkkoon. Rekisteröinnin yhteydessä tietokone saa nimen ja IP-osoitteen. Aina kun se yhdistää verkkoon, DHCP-palvelin määrittää sille saman nimen ja IP-osoitteen. DHCP-palvelin tunnistaa tietokoneet MAC-osoitteen perusteella, joka on jokaiselle verkkokortille (NIC) yksilöllinen. Jos kuitenkin tiedät rekisteröidyn tietokoneen MAC-osoitteen, voit käyttää sitä verkkoon yhdistämiseen väärentämällä MAC-osoitteen: