Arvostelu GE Healthcaren Äkta Avant 25 -laitteesta

Noin vuosi sitten saimme rahoitusta tiedekunnan sisäisessä hakukierroksessa vanhan Pharmacia Äkta Explorer 100 FPLC -laitteen  Proteiinituotannon ja -puhdistuksen yhteislaitoksessa  . Äkta Explorer oli hankittu vuonna 1996(?), kun ruotsalainen tuotemerkki Pharmacia  oli vielä olemassa. Vuonna 2014 pahin mahdollinen skenaario toteutui, ja sekä monokromaattori  että ksenon-salamalamput  rikkoutuivat lähes samanaikaisesti, mikä aiheutti meille lähes 10 000 euron laskun. Siksi halusimme korvata laitteen nykyaikaisemmalla mallilla. Tällä alalla on vain kaksi yritystä, jotka tarjoavat luotettavia laitteita: GE Healthcare  ( Äkta-tuotelinja  ) ja BioRad  ( NGC-tuotelinja  ). GE Healthcare peri Äkta-tuotemerkin Pharmacialta useiden fuusioiden kautta, kun taas BioRad on suhteellisen uusi kilpailija NGC-malleillaan, jotka se toi markkinoille vasta muutama vuosi sitten.Päätimme valita Äkta Avant 25  . Halusimme ehdottomasti koteloidun, jäähdytetyn fraktiokerääjän. Halusimme myös tutun käyttökokemuksen. Suoritamme usein automatisoituja puhdistuksia, emmekä halua proteiinejamme olevan pitkiä aikoja huoneenlämmössä avoimissa putkissa, joihin bakteerit ja ilmasta tuleva pöly voivat päästä. Tähän mennessä olemme käyttäneet Äkta Avantia noin puoli vuotta, ja meillä on jo hyvä käsitys siitä, miten se vertautuu Äkta Exploreriin. Vaikka Avant on modernimpi kuin Explorer, kaikki ydinlaitoksemme käyttäjät käyttävät edelleen Exploreria. He ovat tottuneet Unicorn 5.11:n käyttöliittymään eivätkä näytä olevan kiinnostuneita oppimaan Avantin – myönnettäköön – monimutkaisempaa käyttöliittymää. Toinen syy siihen, että laitetta on toistaiseksi käytetty vain sisäisesti, oli kuitenkin se, että olemme kohdanneet melkoisen määrän ongelmia. Vanhan Äkta Explorer -laitteemme kanssa emme ole koskaan kohdanneet niin monia ongelmia niin lyhyessä ajassa peräkkäin. En tiedä, onko tilanteemme tyypillinen (GE Healthcaren edustajien mukaan se ei ole). Siitä huolimatta tässä ovat ongelmat, joita olemme kohdanneet:

1. Tietokonevika

2. FR-902-virtauksenrajoittimen tukkeutuminen

3. Selittämätön ja jatkuva näytteen suoran syöttämisen keskeytyminen kolonnille, vaikka letkuissa ei näkynyt ilmaa

4. Järjestelmän pääpumpun vuoto (noin 1 % pumpun läpi kulkevasta puskuriliuoksesta hävisi pumpun huuhtelujärjestelmään)

5. Tiedonsiirto- ja virransyöttöhäiriöt

6. Selittämätön ilman havaitseminen B-tuloventtiilissä

7. Ohjaus tietokoneen kiintolevy petti muutaman kuukauden käytön jälkeen. Tämä tapahtui proteiinien puhdistuskurssin  aikana, jonka järjestimme biolääketieteen tohtoriohjelmalle  . Tietokone hidastui niin paljon, että Avant-laitteen ohjaaminen oli mahdotonta, ja Intel RAID -demoni vilkkui varoittaen meitä lähestyvästä katastrofista. Vaikka ostimme järjestelmän GE Healthcare -yhtiöltä, he siirtivät vastuun tietokoneen valmistajalle ( HP  ). Kesti kokonaisen päivän (useita sähköposteja, puheluita ja verkkopuheluita), ennen kuin onnistuin vihdoin selvittämään, miten saisin kiintolevyn vaihdettua takuuehtojen mukaisesti (HP:n tapausnumero 4652993752). Ainoa keino oli ottaa yhteyttä paikalliseen (suomalaiseen) HP:n tukeen puhelimitse. Kun olin kuitenkin tehnyt niin, HP:ltä kesti vain 17 tuntia toimittaa uusi kiintolevy työpöydälleni. IT-tuki vaihtoi sen, ja noin neljän tunnin RAID-järjestelmän uudelleenrakennuksen jälkeen pystyimme jälleen käyttämään Äktaa (Unicorn kieltäytyi toimimasta, kun RAID-järjestelmä oli uudelleenrakennuksen keskellä). Noin kuukausi tämän tapauksen jälkeen HP alkoi vaivata minua ja kehottaa palauttamaan viallisen kiintolevyn. Puhelinkeskustelun aikana minulle ei ollut kerrottu, että minun odotettiin palauttavan viallinen levy. Levy oli todennäköisesti päätynyt IT-tukemme hävitykseen, mutta vaikka he olisivatkin säilyttäneet sen, en ole innokas lisäämään uutta pyyntöä ylikuormitetun (ja tällä hetkellä käytännössä olemattoman) IT-osastomme tukijonoon, jonka keskimääräinen pituus on noin 500 pyyntöä (mistä seuraa viikkojen tai kuukausien vastausajat ongelman kiireellisyydestä riippuen). 2. Myöhemmin samana päivänä aloitimme menetelmäkokeen Fc-merkityn proteiinin puhdistamiseksi proteiini A  -kolonnin avulla. Latasimme 400 ml käsiteltyä soluviljelyväliainetta 5 ml:n HiTap rProtein A FF -kolonniin  . Olemme tehneet tämän monta kertaa aiemminkin, mutta tällä kertaa paine kolonnissa nousi nopeasti, ja Äkta laski virtausnopeutta asianmukaisesti, jotta kolonnia ei vahingoitettaisi. Noin kahden tunnin kuluttua virtausnopeus oli noin 0,1 ml/ml. Ehkä unohdimme puhdistaa näytteen sentrifugoimalla tai suodattamalla, ja online-suodatin  oli tukkeutunut. Kokeilin monia asioita ilman tulosta ja lopulta irrotin virtausreitistä jokaisen osan yksitellen paikantaakseni tukoksen lähteen. Lopulta tunnistin syyksi FR-902 virtauksenrajoittimen  . 20 vuoden aikana, jonka olen käyttänyt Äkta Exploreria, en ole koskaan nähnyt virtauksenrajoittimen tukkeutuvan kokonaan, vaan ainoastaan sen vastuksen kasvaneen. GE:n huoltomies vieraili luonamme saman viikon perjantaina ja yritti puhdistaa sen, mutta turhaan, ja jouduimme odottamaan varaosaa, jonka saimme seuraavalla viikolla.3. Jatkoimme mittausta ilman virtauksenrajoitinta, mutta emme olleet tyytyväisiä tilanteeseen, sillä olimme kamppailleet Avant-laitteella järjestelmään joutuneen ilman kanssa jo useita viikkoja. Ilmanilmaisin oli lauennut ennenaikaisesti, kun latasimme näytettä suoraan kolonnille. Tällaista emme ole koskaan havainneet Explorer-laitteessa. Aluksi ajattelimme, että se saattoi johtua liian pitkistä tai liian kapeista näytteenottoputkista (säilytimme näytteitä Avantin vieressä olevassa jääkaapissa ja käytimme noin 3 metrin pituista näytteenottoputkea). Sitten ajattelimme, että kaasunpoistomme ei ollut riittävää. Mikään ei kuitenkaan parantanut tilannetta. Ongelma hävisi, kun GE:n huoltoteknikko vaihtoi B-pumpun tiivisteet yrittäessään ensin korjata toista ongelmaa: pumpun tiivisteen vuotoa (katso seuraava kappale). 4. Pumpun tiivisteen vuoto huuhteluputkiin. Pumpun huuhtelujärjestelmä  käyttää 50 ml:n Falcon-putkia, jotka on täytetty 20-prosenttisella etanolilla. Jos pumpun tiivisteet eivät ole tiiviitä, juokseva puskuri vuotaa pumpun huuhtelujärjestelmään. Meidän tapauksessamme noin 5 ml puskuria vuoti 500 ml:n geelisuodatuskolonnin ajon aikana (virtausnopeudella 2,6 ml/min ja maksimipaineella 0,5 MPa). Falcon-putket alkoivat vuotaa yli muutaman tunnin käytön jälkeen, ja pumpun huuhteluliuos jouduttiin vaihtamaan päivittäin. Huoltoteknikko kävi paikan päällä ja vaihtoi B-pumpun tiivisteet, mutta se paransi tilannetta vain hieman. Käytimme vuorotellen joko A- tai B-pumppua selvittääksemme, kumpi vuotaa, ja suurin osa vuodoista näytti johtuvan A-pumpusta. Sähköpostitse saimme ehdotuksen, että A-pumpun läpi pitäisi juoksuttaa 95-prosenttista etanolia korkeassa paineessa 1–2 tuntia tiivisteiden sisäänajamiseksi. Teimme niin, ja vuoto väheni noin 50 %. Se oli kuitenkin edelleen liikaa, joten GE päätti vaihtaa sekä A- että B-pumpun tiivisteet ja männät. Vaihto tehtiin viime viikolla, eikä sen jälkeen ole havaittu lainkaan vuotoja.5. Mukana oli myös muita outoja vikoja (kuten satunnaisia tiedonsiirtovirheitä ja joitakin virrankatkoksia). Osa niistä saattoi johtua asennuksen yhteydessä virheellisesti kytketyistä kaapeleista (Avant sijaitsee valitettavasti sellaisessa paikassa, että sen takapuolella olevia liitäntöjä on vaikea tarkistaa). Viimeisimmän huoltokäynnin aikana huoltoteknikko sai aikaan tällaisen virrankatkoksen ja havaitsi, että virtajohto oli kytketty niin löyhästi, että kosketus oli hädin tuskin riittävä, ja laitteen pienet liikkeet saattoivat aiheuttaa virrankatkoksia.6. Ilman havaitseminen B-sisäänvirtausventtiilissä ilman ilmeistä lähdettä. Tämä on se ongelma, joka vaivaa meitä tällä hetkellä sen jälkeen, kun ongelmat 1–5 on ratkaistu. Se alkoi pian viimeisen huoltokäynnin jälkeen. Aloimme saada satunnaisia hälytyksiä B-venttiilissä havaitun ilman vuoksi. Aluksi emme kiinnittäneet niihin erityistä huomiota, mutta nyt ne toistuvat noin 30 minuutin välein, ja olemme jälleen tutkimassa asiaa: tuloputket ovat täynnä, eikä niissä näy kuplia; ilmahälytys ei laukea, kun näytettä otetaan B1:stä, mikä todennäköisesti tarkoittaa, että pumppu itsessään on kunnossa, mutta että ongelma on B-sisäänvirtausventtiilissä tai liittyy siihen. Koska emme kuitenkaan tehneet mitään muutoksia B-sisäänvirtausventtiiliin, tämä tuntuu joka tapauksessa oudolta… Yhteenvetona: Jos meidän pitäisi tänään valita Äkta Avantin ja BioRad NGC DiscoverTM 100 Pron välillä, valitsisin todennäköisesti BioRad-laitteen. Monien ongelmien aiheuttama ylimääräinen työmäärä on huomattava. Menetettyinä työtunteina mitattuna kustannukset nousisivat useisiin tuhansiin euroihin. Lisäksi emme olleet kovin tyytyväisiä GE:n pääosin pitkiin vastausaikoihin tukipyyntöihimme. Samaan aikaan Äkta Explorer toimii jatkuvasti ja moitteettomasti joka päivä ilman, että kukaan huolehtii siitä… Vertaan Avantia Ferrariin, kun taas Explorer on ”vain” työjuhta. Ferrareita on ehkä ilo ajaa, mutta ne ovat kuuluisampia suorituskyvystään ja tyylistään kuin rakenteellisesta laadustaan. Ilman Exploreria olisin jo kauan sitten harkinnut Avantin palauttamista, sillä se ei ole ollut riittävän luotettava todelliseen tuotantokäyttöön siitä lähtien, kun saimme sen. En voi verrata tilannettani muihin Avant-käyttäjiin (koska en henkilökohtaisesti tunne muita Avant-käyttäjiä). Jos se, mitä GE:n edustajat kertovat minulle, on totta, niin kymmeniä Avant-laitteita on raskaassa tuotantokäytössä ilman minkäänlaisia ongelmia. Siinä tapauksessa olemme saaneet koneen, jonka joku insinööri on koonnut maanantaiaamuna rankan juhli-viikonlopun jälkeen. Jos asia on näin, GE Healthcaren tulisi kantaa täysi vastuu.UNICORN 7 -ohjelmistoUusi UNICORN 7  -ohjelmisto on joissakin suhteissa parempi, mutta toisissa huonompi. Kaipaamme kovasti mahdollisuutta sammuttaa UV-lamppu kokonaan. Ksenon-salamalampun vaihtaminen on kallista (yli 1500 euroa), ja koska meillä on pitkiä ajoja (esim. näytteiden suora lataaminen kolonnille yön yli), tämä lyhentää ksenonlampun käyttöikää huomattavasti. Meidän piti vaihtaa Äkta Explorerin ksenonlamppu kolme kertaa 20 vuoden aikana. Olemme karkeasti laskeneet, että ilman sammutusmahdollisuutta lampun keskimääräinen käyttöikä lyhenee noin 50 %:iin (eli joudumme vaihtamaan sen joka kolmas vuosi). Vaihtoehtoisesti GE Healthcare voisi ottaa käyttöön lampulle ”pitkän näytteenottovälin tilan” (esim. mitata optisen tiheyden vain 10 sekunnin välein), mikä olisi enemmän kuin riittävä pitkissä ajoissa, joissa ei oikeastaan tapahdu mitään.Uuden ohjelmiston toinen merkittävä haittapuoli on uusi arviointimoduuli. Oletusasetus (”arviointi aloittelijoille”) riittää usein, mutta ei aina. Se tuntuu aivan beta-versiolta, jossa on paljon virheitä ja puuttuvia ominaisuuksia. Jos haluat tehdä monimutkaisempia analyysejä, sinun on siirryttävä ”klassiseen tilaan”. Klassisen tilan on tarkoitus olla hyvin samanlainen kuin arviointimoduuli UNICORN 5 -ohjelmistossa. Siitä on kuitenkin poistettu joitakin erittäin hyödyllisiä ominaisuuksia (esim. näytteiden yhdistely on nyt todella hankalaa, kun se UNICORN 5:ssä sujui vaivattomasti). Kukaan ei oikeastaan ymmärrä, miksi he poistivat toimivan ominaisuuden, josta lähes kaikki pitivät ja jota käyttivät, ja korvasivat sen kömpelöllä, epäintuitiivisella työnkululla. Viimeisenä mutta ei vähäisimpänä meillä on asiakasohjelmisto (joka on kelluva lisenssi ohjelmistolle Avantin etävalvontaan ja -ohjaukseen). Ensinnäkin lisenssin asennus on erittäin hankalaa (itse asiassa jonkun GE Healthcaren edustajan piti tulla käymään luonamme, jotta tämä ohjelmisto saatiin asennettua Macbookiini). Koska se toimii vain Windowsissa, jouduimme ajamaan sitä emulaatiossa. Käytimme Oraclen ilmaista Virtual Boxia  , joka toimii erinomaisesti. Koska olen kuitenkin sittemmin palannut Ubuntun  käyttöön, kukaan ei ole käyttänyt tätä asiakaslisenssiä viimeisten kolmen kuukauden aikana. On yksinkertaisesti paljon helpompaa käyttää Microsoftin sisäänrakennettua Remote Desktopia  Avantin käyttämiseen. Ohjelmisto on asennettuna jokaiseen Windows-tietokoneeseen, ja MacOSX:lle on saatavilla monia erittäin hyviä asiakasohjelmia ilmaiseksi (esim. Cord  ) ja Linuxille (esim. Remmina  ).Jos olen jättänyt jotain huomiotta tässä Äkta Avant -arvostelussa, kysy rohkeasti sähköpostitse, niin päivitän mielelläni tämän raportin Äkta Avant 25 FPLC:stä!