Oligonukleotidien molekyylipaino ja ekstinktiokerroin

DNA-oligonukleotidien molekyylipainon laskentakaava on:

MW (g/mol) = (nA × 249,08619) + (nG × 265,0811) + (nC × 225,07496) + (nT × 240,07462)

Oligonukleotidin ε:n (epsilon, ekstinktiokerroin) laskemiseksi kaava on:

ε (yksikköinä l/mmol) = A:iden määrä × 15,4 + C:iden määrä × 7,3 + G:iden määrä × 11,4 + T:iden määrä × 8,8.

ε:tä tarvitaan oligonukleotidiliuoksen pitoisuuden laskemiseen 260 nm:n optisen tiheyden (OD) perusteella. Kaava on:

c (mmol/l) = OD(260 nm) / ε