Molekulargewicht und Extinktionskoeffizient von Oligonukleotiden

Die Formel zur Berechnung des Molekulargewichts von DNA-Oligonukleotiden lautet:

MW (g/mol) = (nA × 249,08619) + (nG × 265,0811) + (nC × 225,07496) + (nT × 240,07462)

Die Formel zur Berechnung von ε (Epsilon, dem Extinktionskoeffizienten) eines Oligos lautet:

ε (in l/mmol) = Anzahl der A × 15,4 + Anzahl der C × 7,3 + Anzahl der G × 11,4 + Anzahl der T × 8,8.

ε wird benötigt, um die Konzentration eines Oligos anhand der Optischen Dichte (OD) einer Lösung bei 260 nm zu berechnen. Diese Formel lautet:

c (in mmol/l) = OD(260 nm) / ε