Showdown: GE Healthcaren Äkta vastaan Bio-Radin NGC

Olen puhdistanut proteiineja vuodesta 1996 lähtien. Työskentelin Äkta Explorer -laitteella vuoteen 2015 asti, jolloin päivitimme laitteistomme Äkta Avant  -malliin. Vuonna 2020 laboratoriomme muutti, ja saimme käyttöön Bio-Rad NGC  -laitteen, jota olemme käyttäneet nyt kahden vuoden ajan.Bio-Rad NGC:n kanssa kohtasimme monia ongelmia. Aluksi ajattelin, että tämä saattaisi olla normaalia järjestelmänvaihdon yhteydessä. Odotin ongelmien häviävän yksi kerrallaan. Olihan meillä ollut ongelmia myös silloin, kun vaihdoimme Explorerista Avant-laitteeseen.Kuitenkin kahden vuoden ja kymmenien puhdistuskierrosten jälkeenkin NGC:n ongelmat eivät näytä loppuvan. Aina kun ratkaisemme yhden ongelman, ilmestyy uusi, aiemmin tuntematon ongelma. Ja toisin kuin GE Healthcare, Bio-Radin asiakaspalvelu ei ole lähelläkään sitä, mitä olemme kokeneet GE Healthcaren kanssa. Kun IT-osastomme ei saanut Äktaa kytkettyä yliopistomme verkkoon, GE Healthcare lähetti Münchenin tiimistään insinöörin Helsinkiin korjaamaan ongelman. GE Healthcare arvosti oppimiskäyräämme ja tarjosi lisäksi jollekin tiimimme jäsenelle ilmaisen osallistumisen yhteen kursseistaan. Eikä heidän tukensa rajoittunut takuuaikaan! He todella halusivat meidän olevan tyytyväisiä laitteeseensa. Emme koe saavamme yhtä paljon tukea Bio-Radilta. Tuntuu aina siltä, että meidän on pakotettava heidät ratkaisemaan NGC:n kanssa kohtaamamme ongelmat, ja heidän vasteaikansa on selvästi alle asiakkaiden odotusten.Tämä on ensimmäinen useista blogikirjoituksista, joissa verrataan Äktaa ja NGC:tä. Toivon, että löydän aikaa kirjoittaa tarkemmin kaikista ongelmistamme seuraavien kuukausien aikana.Päätimme vuonna 2015, että tarvitsimme vihdoin uuden FPLC:n. Äkta Explorer -laitteemme oli tulossa käyttöikänsä päähän, ja olimme saaneet noin 100 000 rahoitusta keskuslaitoksemme  FPLC:n uusimiseen. Laite oli niin kallis, että meidän piti käydä läpi virallinen tarjouskilpailumenettely (tuolloin raja oli 30 000 €, mutta se on sittemmin nostettu 60 000 €:ksi). Kilpailijoita oli vain kaksi: Bio-Rad Discover NGC ja GE Healthcare Äkta Avant. Bio-Rad oli halvempi (82 810 € verrattuna 95 470 €), mutta päätimme ostaa GE Healthcaren laitteen. Yksi tärkeä syy oli se, että kaikki käyttäjämme olivat tottuneet käyttämään Äkta Exploreria ja sen Unicorn-ohjelmistoa. Vaihtaminen olisi yksinkertaisesti häiritsevää ja vaatisi meiltä paljon tukea ja aikaa. Oli kuitenkin myös teknisiä syitä, joiden vuoksi pidimme Äktaa parempana kuin NGC:tä: Äkta Avantin edut

1. Jäähdytetty fraktioiden keruu Jäähdytetyn fraktioiden keruun ”simuloimiseksi” olemme sijoittaneet NGC:n fraktiokerääjän kylmähuoneeseen. Se on hätäratkaisu. Elektroniikka (kaapelit) ei ole sertifioitu kyseiseen ympäristöön, ja tiivistynyt vesi aiheuttaa RJ-45-liittimien hapettumista. Olemme kamppailleet melko paljon fraktiokerääjän epäluotettavan liitännän kanssa järjestelmään. Olen itse asiassa yllättynyt, että näiden ongelmien ilmenemiseen kesti 10 vuotta, mutta nyt ne ovat tulleet esiin. Kun yhteys katkeaa, irrotamme ja kytkemme kaapelin uudelleen muutaman kerran, ja järjestelmä alkaa toimia taas (uudelleenkäynnistyksen jälkeen).
2. Paremmat pumput Äktan pumput ovat yksinkertaisesti parempia. Ne pystyvät tuottamaan paljon korkeampia paineita. Epäilen, että kukaan tarvitsee yli 25 ml/min virtausnopeuksia, mutta korkeat paineet voivat joskus olla hyödyllisiä.
3. Laajempi dynaaminen alue UV-anturissa Äktan UV-anturin dynaaminen alue on lähes kaksi kertaa niin suuri kuin Bio-Rad-laitteen. Itse asiassa ylittämme nykyisellä Bio-Rad-kokoonpanollamme usein dynaamisen alueen korkeiden proteiinipitoisuuksien vuoksi. Kyllä, UV-kennoa voi vaihtaa, mutta kukaan ei oikeasti halua konfiguroida laitetta jatkuvasti uudelleen. NGC pystyy mittaamaan samanaikaisesti neljää aallonpituutta, kun taas Äkta vain kolmea. Toistaiseksi emme ole koskaan tarvinneet enempää kuin kolmea: 215, 280 ja mahdollisen värillisen proteiinin, kuten GFP:n, väriaallonpituutta. Mutta jos tarvitset neljää aallonpituutta, NGC saattaa olla parempi valinta, vaikka Äktaan voisi syöttää myös ulkoisen anturin signaalin.

Jälkikäteen, kahden vuoden NGC-kokemuksen jälkeen, olen erittäin tyytyväinen siihen, että valitsimme vuonna 2015 Äkta Avantin NGC:n sijaan. Bio-Radin insinöörit valitsivat ilmeisesti jokaisen yksittäisen komponentin osalta halvimmat toimittajat, kun taas GE Healthcare valitsi pääosin alan standardien mukaiset ratkaisut. Kun verrataan näiden kahden laitteen hinta-laatusuhdetta, Bio-Radista tulee yhtäkkiä kalliimpi vaihtoehto. Seuraavissa blogikirjoituksissa käsittelen muutamia ongelmia, joita kohtasimme NGC:n kanssa, kuten epävakaa UV-anturin perusviiva, huonot oletusasetukset ja puuttuvat ohjelmisto-ominaisuudet. En edes tiennyt, että tällaisia ongelmia oli olemassa, vaikka Äkta Explorer -laitteemme oli yli 20 vuotta vanha eikä sitä huollettu läheskään niin huolellisesti kuin huoltokäsikirjan mukaan olisi pitänyt. Pysy kuulolla, jos haluat tietää, mitä olemme kokeneet Bio-Radin kanssa kahden viime vuoden aikana! Jos sinulla on kysymyksiä proteiinien puhdistuksesta FPLC:llä, ota rohkeasti yhteyttä osoitteeseen michael@jeltsch.org !