Restriktionsenzym-Rechner

Online-Rechner, um die benötigte Menge an Restriktionsenzym für einen Verdau zu berechnen.

Manchmal muss man wissen, wie viel Restriktionsenzym benötigt wird, um eine bestimmte Menge eines Plasmids in einer vorgegebenen Zeit zu schneiden. Hier ist das Berechnungstool, nach dem du gesucht hast! Alle Daten, die für den Algorithmus verwendet wurden, stammen von New England Biolabs (NEB). Das Überleben des Enzyms in der Reaktion wurde aus den von NEB veröffentlichten Experimenten extrapoliert. Gib einfach die Zahlen in das Formular ein und klick auf Submit!

Denk daran, dass viele andere Faktoren die benötigte Enzymmenge erhöhen können, wie z. B. der Puffer, der Grad des Supercoilings usw. Dieser Rechner ist eher dazu gedacht, dir einen groben Richtwert zu geben. Er kann nicht alle Variablen berücksichtigen, die einen Verdau in der Praxis beeinflussen. Vergiss nicht, dass Restriktionsenzyme im Kühlschrank recht alt werden können und mit der Zeit an Aktivität verlieren. Das bedeutet auch, dass ein neu gekauftes Enzym in der Regel mit einem Aktivitätsüberschuss abgefüllt wird, d. h. seine tatsächliche Aktivität ist etwas höher als auf dem Vial angegeben. Als Hersteller möchte man in der Regel einen Sicherheitspuffer haben; nichts ist schlimmer als ein Kunde, der sich über ein inaktives Enzym beschwert. Die hier berechnete Zahl entspricht in etwa der Mindestmenge unter optimalen Bedingungen.

Falls du den Fehler gemacht hast, FastDigest-Enzyme von Thermo Fisher  (TF) zu kaufen, kann dir dieser Rechner nicht helfen, da TF deren Aktivität nicht angibt. Am besten hälst du dich an einen seriösen Anbieter mit vollständiger Transparenz, wie z.B. NEB  . Das Tool geht davon aus, dass die DNA im empfohlenen Puffer bei der empfohlenen Temperatur geschnitten wird.

Bitte beachte, dass ich die NEB-Daten vor etwa 25 Jahren als Doktorand gesammelt und seitdem nicht mehr aktualisiert habe. Ich habe das lokale Tool im April 2025 zu Drupal (PHP) portiert und im Juli 2026 ohne inhaltliche Änderungen in JavaScript umgeschrieben. Wenn ich etwas Zeit finde, aktualisiere ich vielleicht die Daten und baue eventuell die Puffer-Kompatibilität in das Tool ein (was bei Doppelverdauen hilfreich wäre). TF scheitert jedoch auch hier in puncto Transparenz, da viele ihrer Pufferzusammensetzungen ein Geschäftsgeheimnis bleiben. Daher wäre es mit erheblichem Aufwand verbunden, TF-Puffer in dieses Tool zu integrieren.